PerlPrimer is a free, open-source GUI application written in Perl that designs primers for standard PCR, bisulphite PCR, real-time PCR (QPCR) and sequencing. It aims to automate and simplify the process of primer design.
PerlPrimer's current features include the following:
- Calculation of possible primer-dimers
- Retrieval of genomic or cdna sequences from Ensembl (including both sequences automatically for QPCR)
- Ability to BLAST search primers using the NCBI server or a local server
- Results can be saved or optionally exported in a tab-delimited format that is compatible with most spreadsheet applications.
- ORF and CpG island detection algorithms
- Ability to add cloning sequences to primers, automatically adjusted to be in-frame
- QPCR primer design without manual intron-exon boundary entry
PerlPrimer calculates primer melting temperature using J. SantaLucia's extensive nearest-neighbour thermodynamic parameters. To adjust for the salt conditions of the PCR, PerlPrimer uses the empirical formula derived by von Ahsen, et al. (2001) and allows the user to specify the concentration of Mg2+, dNTPs and primers, or use standard PCR conditions. The result is a highly accurate prediction of primer melting temperature, giving rise to a maximum yeild of product when amplified.
PerlPrimer is written in Perl and Perl/Tk. In addition, for QPCR functionality PerlPrimer uses the open-source Spidey executable from NCBI, and restriction enzyme data from the REBASE project is used when adding cloning sites. The program is designed to be cross-platform compatible and has been developed and tested on both Microsoft Windows and GNU/Linux-based operating systems. Users have also reported success using the program under Mac OS X.
Please cite the reference below if this program is useful.
Marshall OJ. PerlPrimer: cross-platform, graphical primer design for standard, bisulphite and real-time PCR. Bioinformatics 2004 20(15):2471-2472 [Pubmed]
وصف الناشر (الإنجليزية)
ما هو برنامج PerlPrimer؟
PerlPrimer برنامج مفتوح المصدر لنظام Windows من Owen Marshall.
التثبيت ومتطلبات التشغيل
تتوفر ملفات تثبيت رسمية لأنظمة 32 بت بصيغة EXE (NSIS). حجم ملف التثبيت الرئيسي 3.4 MB. يتطلب التثبيت صلاحيات المسؤول. يدعم المثبّت التثبيت الصامت دون تدخل من المستخدم.
الشعبية وأنواع الملفات
يسجّل في Windows نوعًا واحدًا من الملفات، منها .ppr.
الإيجابيات / السلبيات
الإيجابيات
- مفتوح المصدر: يمكن لأي شخص فحص الشيفرة وبناؤها
- تثبيت صامت موثّق
- حجم تنزيل صغير (3.4 MB)
السلبيات
- لا يوجد إصدار ARM64 أصلي
- إصدار 32 بت فقط
- يتطلب التثبيت صلاحيات المسؤول
- لم يُحدَّث منذ أكثر من عام
باختصار: PerlPrimer برنامج مفتوح المصدر لنظام Windows يعمل على أجهزة 32 بت. تباطأت وتيرة تحديثاته. يمكن لمسؤولي الأنظمة نشره دون تدخل من المستخدم.
هل تحميل PerlPrimer آمن؟
- يُقدَّم الملف من sourceforge.net، وهو نطاق يملكه الناشر
- رابط التحميل يستخدم HTTPS
- بصمة SHA256 منشورة، فيمكنك التحقق من الملف:
F911658B761F1CA1F09F9A6C11E4540120F7FD7E1A11B328FACD35D03E03E8BB· افتح تقرير VirusTotal لهذه البصمة - استجاب الرابط في آخر فحص (22 أكتوبر 2026)
- الشيفرة المصدرية متاحة للجميع
- لا يستضيف ExeAtlas ملفات التثبيت ولا يغلّفها ولا يعدّلها
شرح ذو صلة: التحقق من بصمة SHA256 لملف في Windows
أحدث الإصدارات
جميع الإصدارات (1) ›| الإصدار | التاريخ | الحجم | الملفات |
|---|---|---|---|
| 1.1.21الأحدث | 21 نوفمبر 2011 | 3.4 MB | 32 بت EXE (NSIS) |
التثبيت من سطر الأوامر
التثبيت الصامت ›winget install --id OwenMarshall.PerlPrimer -edownload /Sشرح ذو صلة: شرح winget: تثبيت البرامج وتحديثها من سطر الأوامر
معلومات
- الناشر
- Owen Marshall
- الترخيص
- GPL-2.0-or-later
- السعر
- مجاني
- المتطلبات
- Windows 11 / 10
- المعمارية
- 32 بت
- نوع المثبّت
- EXE (NSIS)
- الإصدار
- 1.1.21
- تاريخ الإصدار
- 21 نوفمبر 2011
- تاريخ الإضافة إلى الدليل
- 2 أغسطس 2025
- الإصدارات المدرجة
- 1
- الموقع الرسمي
- perlprimer.sourceforge.net
- معرّف winget
- OwenMarshall.PerlPrimer
أنواع الملفات التي يفتحها (1)
التقييمات والمراجعات
لا توجد مراجعات بعد. كن أول من يقيّم هذا البرنامج.
الأسئلة الشائعة
هل برنامج PerlPrimer مجاني؟
نعم. برنامج PerlPrimer مفتوح المصدر ويخضع لترخيص GPL-2.0-or-later.
هل تحميل PerlPrimer آمن؟
يأتي ملف التحميل من sourceforge.net، وهو نطاق يملكه الناشر؛ ولا يستضيف ExeAtlas الملف ولا يعدّله. قارن بصمة SHA256 للملف بالبصمة المعروضة هنا، أو افتح تقرير VirusTotal لهذه البصمة.
كيف أثبّت PerlPrimer باستخدام winget؟
افتح PowerShell أو Windows Terminal وشغّل أمر winget المعروض في هذه الصفحة. ينزّل winget ملف التثبيت الرسمي ويتحقق من بصمة SHA256 قبل تشغيله.
هل يمكن تثبيت PerlPrimer تثبيتًا صامتًا؟
نعم. تعرض صفحة التثبيت الصامت الأمر الدقيق لكل مثبّت.
هل يعمل PerlPrimer على أجهزة Windows on Arm؟
لا يوجد إصدار ARM64؛ لكن Windows 11 on Arm يستطيع تشغيل إصدار 32 بت عبر المحاكاة.