PerlPrimer is a free, open-source GUI application written in Perl that designs primers for standard PCR, bisulphite PCR, real-time PCR (QPCR) and sequencing. It aims to automate and simplify the process of primer design.
PerlPrimer's current features include the following:
- Calculation of possible primer-dimers
- Retrieval of genomic or cdna sequences from Ensembl (including both sequences automatically for QPCR)
- Ability to BLAST search primers using the NCBI server or a local server
- Results can be saved or optionally exported in a tab-delimited format that is compatible with most spreadsheet applications.
- ORF and CpG island detection algorithms
- Ability to add cloning sequences to primers, automatically adjusted to be in-frame
- QPCR primer design without manual intron-exon boundary entry
PerlPrimer calculates primer melting temperature using J. SantaLucia's extensive nearest-neighbour thermodynamic parameters. To adjust for the salt conditions of the PCR, PerlPrimer uses the empirical formula derived by von Ahsen, et al. (2001) and allows the user to specify the concentration of Mg2+, dNTPs and primers, or use standard PCR conditions. The result is a highly accurate prediction of primer melting temperature, giving rise to a maximum yeild of product when amplified.
PerlPrimer is written in Perl and Perl/Tk. In addition, for QPCR functionality PerlPrimer uses the open-source Spidey executable from NCBI, and restriction enzyme data from the REBASE project is used when adding cloning sites. The program is designed to be cross-platform compatible and has been developed and tested on both Microsoft Windows and GNU/Linux-based operating systems. Users have also reported success using the program under Mac OS X.
Please cite the reference below if this program is useful.
Marshall OJ. PerlPrimer: cross-platform, graphical primer design for standard, bisulphite and real-time PCR. Bioinformatics 2004 20(15):2471-2472 [Pubmed]
Descrição do desenvolvedor (inglês)
O que é PerlPrimer?
PerlPrimer é um programa de código aberto para Windows, publicado por Owen Marshall.
Instalação e requisitos
Há instaladores oficiais para 32 bits no formato EXE (NSIS). O instalador principal tem 3,4 MB. A instalação pede permissão de administrador. O instalador aceita instalação automática, sem janelas nem perguntas.
Popularidade e tipos de arquivo
No Windows, registra 1 tipo de arquivo, como .ppr.
Pontos positivos / Pontos negativos
Pontos positivos
- Código aberto: qualquer pessoa pode revisar e compilar o código
- Instalação silenciosa documentada
- Download leve (3,4 MB)
Pontos negativos
- Sem versão nativa ARM64
- Somente 32 bits
- A instalação exige permissão de administrador
- Sem atualização há mais de um ano
Em resumo: PerlPrimer é um programa de código aberto para Windows, disponível para PCs 32 bits. As atualizações ficaram mais espaçadas. Administradores de TI podem implantá-lo sem interação do usuário.
É seguro baixar PerlPrimer?
- O arquivo vem de sourceforge.net, o domínio do próprio desenvolvedor
- O link de download usa HTTPS
- Há um hash SHA256 publicado para você verificar o arquivo:
F911658B761F1CA1F09F9A6C11E4540120F7FD7E1A11B328FACD35D03E03E8BB· Abrir o relatório do VirusTotal para este hash - O link respondeu na última verificação (22 de outubro de 2026)
- O código-fonte é público
- O ExeAtlas não hospeda, encapsula nem modifica instaladores
Guia relacionado: Como verificar o hash SHA256 de um arquivo no Windows
Versões recentes
Todas as 1 versões ›| Versão | Data | Tamanho | Arquivos |
|---|---|---|---|
| 1.1.21Atual | 21 de novembro de 2011 | 3,4 MB | 32 bits EXE (NSIS) |
Instalar pela linha de comando
Instalação silenciosa ›winget install --id OwenMarshall.PerlPrimer -edownload /SGuia relacionado: Como usar o winget: instalar e atualizar programas
Informações
- Desenvolvedor
- Owen Marshall
- Licença
- GPL-2.0-or-later
- Preço
- Grátis
- Requisitos
- Windows 11 / 10
- Arquitetura
- 32 bits
- Instalador
- EXE (NSIS)
- Versão
- 1.1.21
- Lançamento
- 21 de novembro de 2011
- Adicionado ao catálogo
- 2 de agosto de 2025
- Versões registradas
- 1
- Site oficial
- perlprimer.sourceforge.net
- ID do winget
- OwenMarshall.PerlPrimer
Tipos de arquivo que abre (1)
Avaliações
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Perguntas frequentes
PerlPrimer é grátis?
Sim. PerlPrimer é um software de código aberto com licença GPL-2.0-or-later.
É seguro baixar PerlPrimer?
O download vem de sourceforge.net, um domínio do próprio desenvolvedor. O ExeAtlas não hospeda nem altera o arquivo. Você pode comparar o hash SHA256 do arquivo com o que aparece aqui ou abrir o relatório do VirusTotal para esse hash.
Como instalar PerlPrimer pelo winget?
Abra o PowerShell ou o Terminal do Windows e rode o comando winget mostrado nesta página. O winget baixa o instalador oficial e confere o hash SHA256 antes de executá-lo.
Dá para instalar PerlPrimer em modo silencioso?
Sim. A página de instalação silenciosa traz o comando exato para cada instalador.
PerlPrimer roda em ARM (Windows on Arm)?
Não há versão ARM64; o Windows 11 on Arm consegue rodar a versão 32 bits por emulação.