PerlPrimer is a free, open-source GUI application written in Perl that designs primers for standard PCR, bisulphite PCR, real-time PCR (QPCR) and sequencing. It aims to automate and simplify the process of primer design.
PerlPrimer's current features include the following:
- Calculation of possible primer-dimers
- Retrieval of genomic or cdna sequences from Ensembl (including both sequences automatically for QPCR)
- Ability to BLAST search primers using the NCBI server or a local server
- Results can be saved or optionally exported in a tab-delimited format that is compatible with most spreadsheet applications.
- ORF and CpG island detection algorithms
- Ability to add cloning sequences to primers, automatically adjusted to be in-frame
- QPCR primer design without manual intron-exon boundary entry
PerlPrimer calculates primer melting temperature using J. SantaLucia's extensive nearest-neighbour thermodynamic parameters. To adjust for the salt conditions of the PCR, PerlPrimer uses the empirical formula derived by von Ahsen, et al. (2001) and allows the user to specify the concentration of Mg2+, dNTPs and primers, or use standard PCR conditions. The result is a highly accurate prediction of primer melting temperature, giving rise to a maximum yeild of product when amplified.
PerlPrimer is written in Perl and Perl/Tk. In addition, for QPCR functionality PerlPrimer uses the open-source Spidey executable from NCBI, and restriction enzyme data from the REBASE project is used when adding cloning sites. The program is designed to be cross-platform compatible and has been developed and tested on both Microsoft Windows and GNU/Linux-based operating systems. Users have also reported success using the program under Mac OS X.
Please cite the reference below if this program is useful.
Marshall OJ. PerlPrimer: cross-platform, graphical primer design for standard, bisulphite and real-time PCR. Bioinformatics 2004 20(15):2471-2472 [Pubmed]
வெளியீட்டாளரின் விளக்கம் (ஆங்கிலம்)
PerlPrimer என்றால் என்ன?
PerlPrimer என்பது Owen Marshall வெளியிடும் ஓப்பன் சோர்ஸ் Windows மென்பொருள்.
நிறுவலும் தேவைகளும்
32-பிட் கணினிகளுக்கான அதிகாரப்பூர்வ நிறுவிகள் உள்ளன (EXE (NSIS)). முதன்மை நிறுவியின் அளவு 3.4 MB. நிறுவும்போது நிர்வாகி (Administrator) உரிமைகள் கேட்கப்படும். பயனர் தலையீடு இல்லாத (சைலண்ட்) நிறுவலை இதன் நிறுவி ஆதரிக்கிறது.
பிரபலமும் கோப்பு வகைகளும்
Windows-இல் இது 1 கோப்பு வகையைப் பதிவுசெய்கிறது, எடுத்துக்காட்டாக .ppr.
நிறைகள் / குறைகள்
நிறைகள்
- ஓப்பன் சோர்ஸ்: குறியீட்டை யார் வேண்டுமானாலும் பார்க்கலாம், பில்ட் செய்யலாம்
- ஆவணப்படுத்தப்பட்ட சைலண்ட் இன்ஸ்டால்
- சிறிய பதிவிறக்கம் (3.4 MB)
குறைகள்
- நேட்டிவ் ARM64 பதிப்பு இல்லை
- 32-பிட் பதிப்பு மட்டும்
- நிறுவலுக்கு நிர்வாகி உரிமைகள் தேவை
- ஓராண்டுக்கு மேலாகப் புதுப்பிப்பு இல்லை
சுருக்கமாக: PerlPrimer ஒரு 32-பிட் கணினிகளுக்கான ஓப்பன் சோர்ஸ் Windows கருவி. இதன் புதுப்பிப்புகள் குறைந்துவிட்டன. நிர்வாகிகள் இதைப் பயனர் தலையீடு இல்லாமல் பரப்பலாம்.
PerlPrimer பதிவிறக்கம் பாதுகாப்பானதா?
- கோப்பை வழங்குவது sourceforge.net, இது வெளியீட்டாளரின் சொந்த டொமைன்
- பதிவிறக்க இணைப்பு HTTPS பயன்படுத்துகிறது
- SHA256 ஹாஷ் வெளியிடப்பட்டுள்ளது, எனவே கோப்பைச் சரிபார்க்கலாம்:
F911658B761F1CA1F09F9A6C11E4540120F7FD7E1A11B328FACD35D03E03E8BB· இந்த ஹாஷுக்கான VirusTotal அறிக்கையைத் திறக்கவும் - கடைசியாகச் சரிபார்த்தபோது இணைப்பு பதிலளித்தது (22 அக்டோபர், 2026)
- மூலக் குறியீடு பொதுவில் கிடைக்கிறது
- ExeAtlas நிறுவிகளைச் சேமிப்பதோ, சுற்றிக் கட்டுவதோ, மாற்றுவதோ இல்லை
தொடர்புடைய வழிகாட்டி: Windows-இல் கோப்பின் SHA256 ஹாஷைச் சரிபார்ப்பது எப்படி
அண்மைப் பதிப்புகள்
அனைத்து 1 பதிப்புகளும் ›| பதிப்பு | தேதி | அளவு | கோப்புகள் |
|---|---|---|---|
| 1.1.21சமீபத்தியது | 21 நவம்பர், 2011 | 3.4 MB | 32-பிட் EXE (NSIS) |
கமாண்ட் லைன் மூலம் நிறுவுதல்
சைலண்ட் இன்ஸ்டால் ›winget install --id OwenMarshall.PerlPrimer -edownload /Sதொடர்புடைய வழிகாட்டி: winget பயன்படுத்துவது எப்படி: நிறுவல், புதுப்பிப்பு
தகவல்
- வெளியீட்டாளர்
- Owen Marshall
- உரிமம்
- GPL-2.0-or-later
- விலை
- இலவசம்
- தேவை
- Windows 11 / 10
- கட்டமைப்பு
- 32-பிட்
- நிறுவி வகை
- EXE (NSIS)
- பதிப்பு
- 1.1.21
- வெளியான தேதி
- 21 நவம்பர், 2011
- பட்டியலில் சேர்க்கப்பட்டது
- 2 ஆகஸ்ட், 2025
- பட்டியலில் உள்ள பதிப்புகள்
- 1
- இணையதளம்
- perlprimer.sourceforge.net
- winget ID
- OwenMarshall.PerlPrimer
திறக்கும் கோப்பு வகைகள் (1)
மதிப்பீடுகளும் விமர்சனங்களும்
இன்னும் விமர்சனங்கள் இல்லை. முதலில் மதிப்பிடுபவராக நீங்கள் இருங்கள்.
அடிக்கடி கேட்கப்படும் கேள்விகள்
PerlPrimer இலவசமா?
ஆம். PerlPrimer ஒரு ஓப்பன் சோர்ஸ் மென்பொருள் (GPL-2.0-or-later உரிமம்).
PerlPrimer பதிவிறக்கம் பாதுகாப்பானதா?
கோப்பு sourceforge.net தளத்திலிருந்து வருகிறது; அந்தத் தளம் வெளியீட்டாளருக்குச் சொந்தமானது. ExeAtlas கோப்பைச் சேமிப்பதோ மாற்றுவதோ இல்லை. இங்கே காட்டப்பட்டுள்ள SHA256 ஹாஷுடன் அதை ஒப்பிடுங்கள், அல்லது அந்த ஹாஷுக்கான VirusTotal அறிக்கையைத் திறந்து பாருங்கள்.
winget மூலம் PerlPrimer மென்பொருளை எப்படி நிறுவுவது?
PowerShell அல்லது Windows Terminal-ஐத் திறந்து, இந்தப் பக்கத்தில் உள்ள winget கட்டளையை இயக்குங்கள். winget அதிகாரப்பூர்வ நிறுவியைப் பதிவிறக்கி, இயக்கும் முன் அதன் SHA256 ஹாஷைச் சரிபார்க்கும்.
PerlPrimer மென்பொருளை சைலண்ட் இன்ஸ்டால் செய்ய முடியுமா?
ஆம். ஒவ்வொரு நிறுவிக்குமான சரியான கட்டளை சைலண்ட் இன்ஸ்டால் பக்கத்தில் உள்ளது.
PerlPrimer ARM (Windows on Arm) கணினிகளில் இயங்குமா?
ARM64 பதிப்பு இல்லை; Windows 11 on Arm எமுலேஷன் மூலம் 32-பிட் பதிப்பை இயக்க முடியும்.