PerlPrimer is a free, open-source GUI application written in Perl that designs primers for standard PCR, bisulphite PCR, real-time PCR (QPCR) and sequencing. It aims to automate and simplify the process of primer design.
PerlPrimer's current features include the following:
- Calculation of possible primer-dimers
- Retrieval of genomic or cdna sequences from Ensembl (including both sequences automatically for QPCR)
- Ability to BLAST search primers using the NCBI server or a local server
- Results can be saved or optionally exported in a tab-delimited format that is compatible with most spreadsheet applications.
- ORF and CpG island detection algorithms
- Ability to add cloning sequences to primers, automatically adjusted to be in-frame
- QPCR primer design without manual intron-exon boundary entry
PerlPrimer calculates primer melting temperature using J. SantaLucia's extensive nearest-neighbour thermodynamic parameters. To adjust for the salt conditions of the PCR, PerlPrimer uses the empirical formula derived by von Ahsen, et al. (2001) and allows the user to specify the concentration of Mg2+, dNTPs and primers, or use standard PCR conditions. The result is a highly accurate prediction of primer melting temperature, giving rise to a maximum yeild of product when amplified.
PerlPrimer is written in Perl and Perl/Tk. In addition, for QPCR functionality PerlPrimer uses the open-source Spidey executable from NCBI, and restriction enzyme data from the REBASE project is used when adding cloning sites. The program is designed to be cross-platform compatible and has been developed and tested on both Microsoft Windows and GNU/Linux-based operating systems. Users have also reported success using the program under Mac OS X.
Please cite the reference below if this program is useful.
Marshall OJ. PerlPrimer: cross-platform, graphical primer design for standard, bisulphite and real-time PCR. Bioinformatics 2004 20(15):2471-2472 [Pubmed]
प्रकाशक का विवरण (अंग्रेज़ी)
PerlPrimer क्या है?
PerlPrimer Windows के लिए Owen Marshall का एक ओपन सोर्स प्रोग्राम है।
इंस्टॉलेशन और सिस्टम आवश्यकताएँ
32-बिट के लिए आधिकारिक इंस्टॉलर उपलब्ध हैं (EXE (NSIS))। मुख्य इंस्टॉलर का साइज़ 3.4 MB है। इंस्टॉल करते समय एडमिनिस्ट्रेटर अधिकार माँगे जाते हैं। इंस्टॉलर बिना किसी सवाल-जवाब के (साइलेंट) इंस्टॉलेशन सपोर्ट करता है।
लोकप्रियता और फ़ाइल टाइप
Windows पर यह 1 फ़ाइल टाइप रजिस्टर करता है, जिनमें .ppr शामिल हैं।
खूबियाँ / कमियाँ
खूबियाँ
- ओपन सोर्स: कोई भी इसका कोड देख और बिल्ड कर सकता है
- डॉक्यूमेंटेड साइलेंट इंस्टॉल
- छोटा डाउनलोड (3.4 MB)
कमियाँ
- नेटिव ARM64 बिल्ड नहीं है
- सिर्फ़ 32-बिट
- इंस्टॉल करने के लिए एडमिनिस्ट्रेटर अधिकार चाहिए
- एक साल से ज़्यादा समय से कोई अपडेट नहीं
संक्षेप में: PerlPrimer 32-बिट PC के लिए एक ओपन सोर्स Windows टूल है। इसके अपडेट धीमे पड़ गए हैं। एडमिनिस्ट्रेटर इसे बिना किसी यूज़र इनपुट के (अनअटेंडेड) डिप्लॉय कर सकते हैं।
क्या PerlPrimer डाउनलोड करना सुरक्षित है?
- फ़ाइल sourceforge.net से आती है, जो प्रकाशक का अपना डोमेन है
- डाउनलोड लिंक HTTPS का इस्तेमाल करता है
- SHA256 हैश प्रकाशित है, इसलिए आप फ़ाइल की जाँच कर सकते हैं:
F911658B761F1CA1F09F9A6C11E4540120F7FD7E1A11B328FACD35D03E03E8BB· इस हैश की VirusTotal रिपोर्ट खोलें - पिछली जाँच में लिंक ने जवाब दिया (22 अक्टूबर 2026)
- सोर्स कोड सार्वजनिक है
- ExeAtlas इंस्टॉलर को न होस्ट करता है, न रैप करता है, न बदलता है
संबंधित गाइड: Windows पर फ़ाइल का SHA256 हैश कैसे चेक करें
हाल के संस्करण
सभी 1 संस्करण ›| संस्करण | तारीख़ | साइज़ | फ़ाइलें |
|---|---|---|---|
| 1.1.21नवीनतम | 21 नवंबर 2011 | 3.4 MB | 32-बिट EXE (NSIS) |
कमांड लाइन से इंस्टॉल करें
साइलेंट इंस्टॉल ›winget install --id OwenMarshall.PerlPrimer -edownload /Sसंबंधित गाइड: winget कैसे इस्तेमाल करें: ऐप इंस्टॉल और अपडेट
जानकारी
- प्रकाशक
- Owen Marshall
- लाइसेंस
- GPL-2.0-or-later
- कीमत
- मुफ़्त
- ज़रूरी सिस्टम
- Windows 11 / 10
- आर्किटेक्चर
- 32-बिट
- इंस्टॉलर
- EXE (NSIS)
- संस्करण
- 1.1.21
- रिलीज़
- 21 नवंबर 2011
- कैटलॉग में जोड़ा गया
- 2 अगस्त 2025
- सूचीबद्ध संस्करण
- 1
- वेबसाइट
- perlprimer.sourceforge.net
- winget ID
- OwenMarshall.PerlPrimer
कौन-सी फ़ाइलें खोलता है (1)
रेटिंग और रिव्यू
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अक्सर पूछे जाने वाले सवाल
क्या PerlPrimer मुफ़्त है?
हाँ। PerlPrimer ओपन सोर्स सॉफ़्टवेयर है (GPL-2.0-or-later लाइसेंस)।
क्या PerlPrimer डाउनलोड करना सुरक्षित है?
फ़ाइल sourceforge.net से डाउनलोड होती है, जो प्रकाशक का अपना है; ExeAtlas फ़ाइल को न होस्ट करता है, न बदलता है। डाउनलोड की गई फ़ाइल का SHA256 हैश यहाँ दिखाए गए हैश से मिलाएँ, या उस हैश की VirusTotal रिपोर्ट खोलें।
winget से PerlPrimer कैसे इंस्टॉल करें?
PowerShell या Windows Terminal खोलें और इस पेज पर दिया गया winget कमांड चलाएँ। winget आधिकारिक इंस्टॉलर डाउनलोड करता है और चलाने से पहले उसका SHA256 हैश जाँचता है।
क्या PerlPrimer को साइलेंट इंस्टॉल किया जा सकता है?
हाँ। साइलेंट इंस्टॉल पेज पर हर इंस्टॉलर का सटीक कमांड दिया गया है।
क्या PerlPrimer ARM (Windows on Arm) पर चलता है?
ARM64 बिल्ड नहीं है; Windows 11 on Arm पर 32-बिट वर्ज़न एमुलेशन के ज़रिए चल सकता है।