PerlPrimer is a free, open-source GUI application written in Perl that designs primers for standard PCR, bisulphite PCR, real-time PCR (QPCR) and sequencing. It aims to automate and simplify the process of primer design.
PerlPrimer's current features include the following:
- Calculation of possible primer-dimers
- Retrieval of genomic or cdna sequences from Ensembl (including both sequences automatically for QPCR)
- Ability to BLAST search primers using the NCBI server or a local server
- Results can be saved or optionally exported in a tab-delimited format that is compatible with most spreadsheet applications.
- ORF and CpG island detection algorithms
- Ability to add cloning sequences to primers, automatically adjusted to be in-frame
- QPCR primer design without manual intron-exon boundary entry
PerlPrimer calculates primer melting temperature using J. SantaLucia's extensive nearest-neighbour thermodynamic parameters. To adjust for the salt conditions of the PCR, PerlPrimer uses the empirical formula derived by von Ahsen, et al. (2001) and allows the user to specify the concentration of Mg2+, dNTPs and primers, or use standard PCR conditions. The result is a highly accurate prediction of primer melting temperature, giving rise to a maximum yeild of product when amplified.
PerlPrimer is written in Perl and Perl/Tk. In addition, for QPCR functionality PerlPrimer uses the open-source Spidey executable from NCBI, and restriction enzyme data from the REBASE project is used when adding cloning sites. The program is designed to be cross-platform compatible and has been developed and tested on both Microsoft Windows and GNU/Linux-based operating systems. Users have also reported success using the program under Mac OS X.
Please cite the reference below if this program is useful.
Marshall OJ. PerlPrimer: cross-platform, graphical primer design for standard, bisulphite and real-time PCR. Bioinformatics 2004 20(15):2471-2472 [Pubmed]
Opis producenta (angielski)
Czym jest PerlPrimer?
PerlPrimer to program na Windows o otwartym kodzie źródłowym. Producent: Owen Marshall.
Instalacja i wymagania
Oficjalne instalatory są dostępne dla architektur: 32-bit; typ instalatora: EXE (NSIS). Rozmiar głównego instalatora: 3,4 MB. Instalacja wymaga uprawnień administratora. Instalator obsługuje instalację nienadzorowaną (cichą).
Popularność i typy plików
W systemie Windows program rejestruje 1 typ plików, m.in. .ppr.
Zalety / Wady
Zalety
- Otwarty kod źródłowy: każdy może go przejrzeć i skompilować
- Udokumentowana cicha instalacja
- Mały instalator (3,4 MB)
Wady
- Brak natywnej wersji ARM64
- Tylko wersja 32-bitowa
- Instalacja wymaga uprawnień administratora
- Brak aktualizacji od ponad roku
W skrócie: PerlPrimer to program na Windows o otwartym kodzie źródłowym; wersje: 32-bit. Aktualizacje pojawiają się coraz rzadziej. Administratorzy mogą go wdrażać bez udziału użytkownika.
Czy pobieranie programu PerlPrimer jest bezpieczne?
- Plik jest pobierany z domeny producenta (sourceforge.net)
- Link do pobrania używa HTTPS
- Opublikowano sumę SHA256, więc plik można zweryfikować:
F911658B761F1CA1F09F9A6C11E4540120F7FD7E1A11B328FACD35D03E03E8BB· Otwórz raport VirusTotal dla tej sumy - Link odpowiedział przy ostatnim sprawdzeniu (22 października 2026)
- Kod źródłowy jest publiczny
- ExeAtlas nie przechowuje, nie opakowuje i nie modyfikuje instalatorów
Powiązany poradnik: Jak sprawdzić sumę SHA256 pliku w Windows
Najnowsze wersje
Wszystkie wersje (1) ›| Wersja | Data | Rozmiar | Pliki |
|---|---|---|---|
| 1.1.21Najnowsza | 21 listopada 2011 | 3,4 MB | 32-bit EXE (NSIS) |
Instalacja z wiersza poleceń
Cicha instalacja ›winget install --id OwenMarshall.PerlPrimer -edownload /SPowiązany poradnik: Winget – jak instalować i aktualizować programy
Informacje
- Producent
- Owen Marshall
- Licencja
- GPL-2.0-or-later
- Cena
- Za darmo
- Wymagania
- Windows 11 / 10
- Architektura
- 32-bit
- Instalator
- EXE (NSIS)
- Wersja
- 1.1.21
- Data wydania
- 21 listopada 2011
- Dodano do katalogu
- 2 sierpnia 2025
- Wersje w katalogu
- 1
- Strona WWW
- perlprimer.sourceforge.net
- ID winget
- OwenMarshall.PerlPrimer
Obsługiwane typy plików (1)
Oceny i opinie
Brak opinii. Można dodać pierwszą ocenę.
Najczęstsze pytania
Czy program PerlPrimer jest darmowy?
Tak. PerlPrimer to oprogramowanie open source na licencji GPL-2.0-or-later; można je pobrać i używać za darmo.
Czy pobieranie programu PerlPrimer jest bezpieczne?
Plik jest pobierany z serwera sourceforge.net, który należy do producenta; ExeAtlas nie przechowuje ani nie modyfikuje pliku. Sumę SHA256 pobranego pliku można porównać z podaną na tej stronie albo otworzyć raport VirusTotal dla tej sumy.
Jak zainstalować program PerlPrimer przez winget?
Wystarczy otworzyć PowerShell lub Terminal Windows i uruchomić polecenie winget podane na tej stronie. winget pobiera oficjalny instalator i przed uruchomieniem sprawdza jego sumę SHA256.
Czy program PerlPrimer obsługuje cichą instalację?
Tak. Na stronie cichej instalacji podano dokładne polecenie dla każdego instalatora.
Czy PerlPrimer działa na procesorach ARM (Windows on Arm)?
Brak wersji ARM64; Windows 11 on Arm może uruchomić wersję 32-bit w emulacji.