PerlPrimer is a free, open-source GUI application written in Perl that designs primers for standard PCR, bisulphite PCR, real-time PCR (QPCR) and sequencing. It aims to automate and simplify the process of primer design.
PerlPrimer's current features include the following:
- Calculation of possible primer-dimers
- Retrieval of genomic or cdna sequences from Ensembl (including both sequences automatically for QPCR)
- Ability to BLAST search primers using the NCBI server or a local server
- Results can be saved or optionally exported in a tab-delimited format that is compatible with most spreadsheet applications.
- ORF and CpG island detection algorithms
- Ability to add cloning sequences to primers, automatically adjusted to be in-frame
- QPCR primer design without manual intron-exon boundary entry
PerlPrimer calculates primer melting temperature using J. SantaLucia's extensive nearest-neighbour thermodynamic parameters. To adjust for the salt conditions of the PCR, PerlPrimer uses the empirical formula derived by von Ahsen, et al. (2001) and allows the user to specify the concentration of Mg2+, dNTPs and primers, or use standard PCR conditions. The result is a highly accurate prediction of primer melting temperature, giving rise to a maximum yeild of product when amplified.
PerlPrimer is written in Perl and Perl/Tk. In addition, for QPCR functionality PerlPrimer uses the open-source Spidey executable from NCBI, and restriction enzyme data from the REBASE project is used when adding cloning sites. The program is designed to be cross-platform compatible and has been developed and tested on both Microsoft Windows and GNU/Linux-based operating systems. Users have also reported success using the program under Mac OS X.
Please cite the reference below if this program is useful.
Marshall OJ. PerlPrimer: cross-platform, graphical primer design for standard, bisulphite and real-time PCR. Bioinformatics 2004 20(15):2471-2472 [Pubmed]
Descrierea dezvoltatorului (engleză)
Ce este PerlPrimer?
PerlPrimer este un program open source pentru Windows, publicat de Owen Marshall.
Instalare și cerințe
Există instalatoare oficiale pentru 32 de biți, în format EXE (NSIS). Instalatorul principal are 3,4 MB. Instalarea cere drepturi de administrator. Instalatorul permite o instalare automată, fără ferestre și fără întrebări.
Popularitate și tipuri de fișiere
În Windows înregistrează un tip de fișier, printre care .ppr.
Avantaje / Dezavantaje
Avantaje
- Open source: codul poate fi verificat și compilat de oricine
- Instalare silențioasă documentată
- Descărcare mică (3,4 MB)
Dezavantaje
- Fără versiune nativă ARM64
- Doar pe 32 de biți
- Instalarea necesită drepturi de administrator
- Nicio actualizare de mai bine de un an
Pe scurt: PerlPrimer este un program open source pentru Windows, disponibil pentru calculatoare cu 32 de biți. Actualizările s-au rărit. Administratorii de sistem îl pot distribui fără intervenția utilizatorului.
Este sigur să descărcați PerlPrimer?
- Fișierul este livrat de sourceforge.net, domeniul dezvoltatorului
- Linkul de descărcare folosește HTTPS
- Există un hash SHA256 publicat pentru verificarea fișierului:
F911658B761F1CA1F09F9A6C11E4540120F7FD7E1A11B328FACD35D03E03E8BB· Deschideți raportul VirusTotal pentru acest hash - Linkul a răspuns la ultima verificare (22 octombrie 2026)
- Codul sursă este public
- ExeAtlas nu găzduiește, nu împachetează și nu modifică instalatoare
Ghid asociat: Cum verificați hash-ul SHA256 al unui fișier în Windows
Versiuni recente
O singură versiune ›| Versiune | Data | Dimensiune | Fișiere |
|---|---|---|---|
| 1.1.21Cea mai nouă | 21 noiembrie 2011 | 3,4 MB | 32 de biți EXE (NSIS) |
Instalare din linia de comandă
Instalare silențioasă ›winget install --id OwenMarshall.PerlPrimer -edownload /SGhid asociat: Cum se folosește winget: instalare și actualizare
Informații
- Dezvoltator
- Owen Marshall
- Licență
- GPL-2.0-or-later
- Preț
- Gratuit
- Cerințe
- Windows 11 / 10
- Arhitectură
- 32 de biți
- Instalator
- EXE (NSIS)
- Versiune
- 1.1.21
- Data lansării
- 21 noiembrie 2011
- Adăugat în catalog
- 2 august 2025
- Versiuni listate
- 1
- Site web
- perlprimer.sourceforge.net
- ID winget
- OwenMarshall.PerlPrimer
Tipuri de fișiere pe care le deschide (1)
Evaluări și recenzii
Nicio recenzie încă.
Întrebări frecvente
Este PerlPrimer gratuit?
Da. PerlPrimer este un software open source cu licența GPL-2.0-or-later.
Este sigur să descărcați PerlPrimer?
Fișierul se descarcă de pe sourceforge.net, un domeniu care aparține dezvoltatorului. ExeAtlas nu găzduiește și nu modifică fișierul. Hash-ul SHA256 al fișierului poate fi comparat cu cel afișat aici, iar raportul VirusTotal pentru acel hash poate fi deschis de pe această pagină.
Cum se instalează PerlPrimer cu winget?
Deschideți PowerShell sau Windows Terminal și rulați comanda winget afișată pe această pagină. winget descarcă instalatorul oficial și îi verifică hash-ul SHA256 înainte de a-l rula.
Se poate instala PerlPrimer silențios?
Da. Pagina de instalare silențioasă conține comanda exactă pentru fiecare instalator.
Funcționează PerlPrimer pe ARM (Windows on Arm)?
Nu există o versiune ARM64; Windows 11 on Arm poate rula versiunea pentru 32 de biți prin emulare.