PyMOL ist eine freie 3D-Grafiksoftware, die zur Darstellung von Biomolekülen in der Biochemie und Bioinformatik dient. Neben der Verwendung der wichtigsten in der Strukturbiologie gebräuchlichen Datenformate erlaubt PyMOL auf verschiedenen Betriebssystemen das Rendern von Grafiken mit hoher Qualität.
Der amerikanische Biophysiker Warren L. DeLano entwickelte PyMOL ab 1998 und stellte es im Jahr 2000 im Internet vor. Seine Absicht war es, ein frei verfügbares benutzerfreundliches Programm für die akademische Forschung und die pharmazeutische Industrie zu schaffen, das 3D-Grafiken von Kleinmolekülen und großen Proteinen oder Nukleinsäuren mit hoher Auflösung erzeugen kann. Eine Voraussetzung für den Erfolg von PyMOL war die Auslegung für verschiedene Computer-Betriebssysteme. Mit der Gründung der Firma DeLano Scientific LLC im Jahr 2003 wurde PyMOL erstmals vermarktet, ohne die Open-Source-Strategie aufzugeben, die DeLano als wichtige Grundlage wissenschaftlichen Arbeitens in Forschung und Lehre ansieht. Im August 2006 führte DeLano Scientific das sogenannte kontrollierte Herunterladen (controlled-access download) vorkompilierter Versionen von PyMOL ein. Der Zugang zu diesen Versionen wird über den Erwerb von Lizenzen geregelt. Die Preise sind je nach Anwendertyp gestaffelt, beispielsweise zahlt ein akademischer Forscher 50 $ pro Jahr, hingegen ein Benutzer aus der Industrie 100
Was ist PyMOL?
PyMOL ist ein proprietäres Windows-Programm aus der Kategorie „Programmiersprachen & SDKs“ von Schrodinger, Inc. (entwickelt von Schrödinger). Die erste Version erschien 2010. Programmiersprache: Python. Neben Windows gibt es Versionen für Plattformunabhängig.
Installation und Systemvoraussetzungen
Offizielle Installationsdateien gibt es für 64-Bit im Format EXE (NSIS). Das Haupt-Setup ist 427,9 MB groß. Für die Installation sind Administratorrechte nötig. Das Setup unterstützt eine unbeaufsichtigte Installation ohne Rückfragen.
Updates und Versionsverlauf
Aktuell ist Version 3.1.9, veröffentlicht am 7. Oktober 2026. Gelistet sind 9 Versionen seit 5. Februar 2025, jede mit Links zu ihren eigenen Installationsdateien. Das entspricht etwa 5,4 Releases pro Jahr. Das letzte Update ist weniger als einen Monat alt.
Verbreitung und Dateitypen
Wikipedia hat in 15 der auf dieser Website angebotenen Sprachen einen Artikel dazu. Unter Windows registriert das Programm 11 Dateitypen, darunter .pdb, .xyz, .cif, .mol und .sdf. Vergleichbare Programme sind etwa Go Programming Language, LLVM und Deno.
Vorteile / Nachteile
Vorteile
- Dokumentierte stille Installation
- In den letzten zwei Monaten aktualisiert
- Läuft auch unter Plattformunabhängig
- Langjähriges Projekt (seit 2010)
Nachteile
- Proprietäre Lizenz: Bedingungen und Preis prüfen
- Keine native ARM64-Version
- Installation erfordert Administratorrechte
- Großer Download (427,9 MB)
Kurz gesagt: PyMOL ist ein Tool aus der Kategorie „Programmiersprachen & SDKs“ für PCs mit 64-Bit. Es wird aktiv gepflegt. Administratoren können es unbeaufsichtigt verteilen.
Ist der Download von PyMOL sicher?
- Die Datei kommt von storage.googleapis.com; prüfen Sie, ob das ein offizieller Mirror des Herstellers ist
- Der Download-Link verwendet HTTPS
- Ein SHA256-Hash ist veröffentlicht, die Datei lässt sich also prüfen:
C36FE9B4DFF44E286F72A3119DBB362BD97C892ECD9DB2E14408ECB74F325442· VirusTotal-Bericht zu diesem Hash öffnen - Der Link hat bei der letzten Prüfung geantwortet (27. Oktober 2026)
- ExeAtlas hostet, verpackt oder verändert keine Installer
Passende Anleitung: SHA256-Hash einer Datei unter Windows prüfen
Neueste Versionen
Alle 9 Versionen ›9 Versionen in 2 Jahren · etwa 5,4 pro Jahr
| Version | Datum | Größe | Dateien |
|---|---|---|---|
| 3.1.9Aktuell | 7. Oktober 2026 | 427,9 MB | 64-Bit EXE (NSIS)64-Bit EXE (NSIS) |
| 3.1.8 | 18. März 2026 | 385,3 MB | 64-Bit EXE (NSIS)64-Bit EXE (NSIS) |
| 3.1.7.2 | 4. März 2026 | — | 64-Bit EXE (NSIS)64-Bit EXE (NSIS) |
| 3.1.6.1 | 9. Juni 2025 | — | 64-Bit EXE (NSIS)64-Bit EXE (NSIS) |
| 3.1.6 | 6. Juni 2025 | — | 64-Bit EXE (NSIS)64-Bit EXE (NSIS) |
| 3.1.5.1 | 8. Mai 2025 | — | 64-Bit EXE (NSIS)64-Bit EXE (NSIS) |
| 3.1.4.1 | 26. März 2025 | — | 64-Bit EXE (NSIS)64-Bit EXE (NSIS) |
| 3.1.4 | 14. März 2025 | — | 64-Bit EXE (NSIS)64-Bit EXE (NSIS) |
Installation per Kommandozeile
Silent Install ›winget install --id Schrodinger.PyMOL -ePyMOL-3.1.9-Windows-x86_64.exe /SPassende Anleitung: winget-Anleitung: Programme installieren und updaten
Auch für andere Systeme
brew install pymolInformationen
- Hersteller
- Schrodinger, Inc.
- Entwickler
- Schrödinger
- Kategorie
- Programmiersprachen & SDKs
- Lizenz
- Proprietary
- Preis
- Siehe Website des Herstellers
- Programmiersprache
- Python
- Voraussetzung
- Windows 11 / 10
- Architektur
- 64-Bit
- Installer
- EXE (NSIS)
- Weitere Plattformen
- Plattformunabhängig
- Version
- 3.1.9
- Veröffentlicht
- 7. Oktober 2026
- Erste Version
- 2010
- Im Katalog seit
- 6. Februar 2025
- Erfasste Versionen
- 9
- Updates pro Jahr
- 5,4
- Website
- pymol.org
- winget-ID
- Schrodinger.PyMOL
Unterstützte Dateitypen (11)
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Alternativen zu PyMOL
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Open Source263.649 ↓
Häufige Fragen
Ist PyMOL kostenlos?
PyMOL ist proprietäre Software (Closed Source), Lizenz: Proprietary. Ob sie etwas kostet, hängt von der Edition ab: Preise und kostenlose Varianten nennt die Website des Herstellers.
Ist der Download von PyMOL sicher?
Die Datei kommt von storage.googleapis.com; ExeAtlas hostet oder verändert sie nicht. Vergleichen Sie den SHA256-Hash der heruntergeladenen Datei mit dem hier angezeigten oder öffnen Sie den VirusTotal-Bericht zu diesem Hash.
Wie installiere ich PyMOL mit winget?
Öffnen Sie PowerShell oder Windows Terminal und führen Sie den winget-Befehl auf dieser Seite aus. winget lädt das offizielle Setup herunter und prüft vor dem Start den SHA256-Hash.
Lässt sich PyMOL still (silent) installieren?
Ja. Die Seite zur stillen Installation nennt für jeden Installer den genauen Befehl.
Läuft PyMOL auf ARM (Windows on Arm)?
Eine ARM64-Version gibt es nicht; Windows 11 on Arm kann die Version für 64-Bit per Emulation ausführen.
Wo kann ich eine ältere Version von PyMOL herunterladen?
Die Versionsseite listet alle 9 Versionen seit 5. Februar 2025 mit Links zu den offiziellen Installationsdateien.
Kann ich PyMOL ohne Administratorrechte nutzen?
Ja, es gibt einen Installer für den einzelnen Benutzer, der keine Administratorrechte braucht.
Welche Alternativen zu PyMOL gibt es?
Go Programming Language, LLVM, Deno, CMake und Yarn. Die Seite mit den Alternativen vergleicht sie.
