Agentero: vanhemmat versiot ja versiohistoria

0.12.0 把论文从单篇笔记扩展成可展开的多文档工作区：文件树显示论文根目录的额外笔记与 HTML，阅读布局可以最大化当前面板并固定左右两栏，侧栏宽度和主窗口状态也会跨重启保留。同步能力同时补齐了 Git 全库后端与无桌面环境的 agentero sync，并带来自建 MinerU，以及缩放性能、PDF 注释和 Agent 安装方面的改进与修复。
新功能
- 自建 MinerU: 设置中新增「自建 API」开关，默认仍走官方云；打开后自动识别 MinerU 4.0+ V1 与 3.x /tasks，支持局域网 http 与 Bearer 鉴权，版面分析和 PAPER.md 正文解析都走自建服务。（#763 by @exciton00）
- Git 全库同步：设置 → 同步新增 Git 后端，Vault 根目录直接作为 work tree，可配置仓库地址和分支（默认 main），支持 GitHub / GitLab / 自建 Git / 本地裸仓库；使用系统 Git 凭据或 SSH，支持手动与自动同步，冲突时走 Git 原生三方合并并中止，不自动解决。（93ba55b9 by @qychen2001）
改进
- 缩放与长笔记性能：拖动面板分隔条、左右 rail 或缩放窗口时，编辑器不再逐帧重跑容器查询，PDF 视口指标与 Markdown 重排共用同一个手势信号；TOC 观察器改为长生命周期，数学公式只渲染视口附近并保留占位尺寸。复现用例中的文档 DOM 节点从 202,986 降到 13,424。（#777 by @Fengsuid）
修复
- 长笔记静默截断：正文含 LaTeX 大括号或 $\rho<1$ 等 MDX 易误判内容时，编辑器不再只渲染前一部分并丢弃后续内容；MDX 解析失败会回退为完整正文，状态栏字数也计入公式文本。（#777 by @Fengsuid）
- PDF 注释删除与译文命中：删除高亮后立即持久化，删除请求不会再因提交锁被丢弃；已删除注解不再参与渲染、命中测试和编辑。全文翻译盖住原文时，点击译文中的高亮仍能打开注解菜单。（a745a446 by @qychen2001）
- 启动后侧栏宽度：macOS 启动时窗口恢复或最大化完成后会重新应用侧栏比例，Agent 栏不再以窄宽度启动。（88283547 by @Phil-Fan）
- Windows 触控板捏合缩放：Windows 精准触控板可以双指捏合缩放 PDF，无需按住 Ctrl；论文之外的捏合不会连带放大整个应用窗口。（dc3ea261 by @JiaheChen2002）
已解决问题
- 论文多文档：论文根目录有多个 .md / .html / .htm 文档时，文件树会列出额外笔记和快照，PAPER.md 不再作为重复子项；论文行右键可直接新建文件，阅读布局打开另一条笔记时复用现有 NOTES 面板，切换论文或笔记时文件树不再短暂空白。（#738 by @Phil-Fan）
- 左论文右笔记布局：工作区恰好为左右两栏时，新打开的论文正文固定进入左栏、其 NOTES 固定进入右栏，不再跟随当前焦点；其他布局仍保持自由放置。（#749, #785 by @Phil-Fan）
- 阅读布局：阅读模式会收起两侧栏并最大化当前面板，多标签或多栏工作区同样生效；再次切换可恢复之前的预设或自定义侧栏。（#764 by @Phil-Fan）
- 侧栏折叠动画：折叠和展开改为一次性提交最终布局，不再用 200ms 动画逐帧重排，PDF fit-width 不会在折叠时来回缩放。（#757 by @Phil-Fan）
- Agent 栏与窗口状态：Agent 栏宽度在布局预设和重启后保持一致，旧版按槽位保存的宽度会自动迁移；主窗口的尺寸、位置和最大化状态也会恢复。（#782 by @qychen2001）
- 文件重命名：文件树按 Enter 直接进入重命名；把文件重命名为无扩展名时转换为同名文件夹，并把原文件保留原后缀移入其中。（#759 by @Phil-Fan）
- Markdown 大纲标记：折叠大纲的标题标记固定在侧栏右缘，悬停展开时不再随标签缩进而移动。（#758 by @Phil-Fan）
- Zotero 入口：Zotero 迁移与同步操作移入 Vault 切换器，更容易找到。（#750 by @Phil-Fan）
- 论文代码仓库：论文元信息新增可手动维护的代码仓库链接，Paper Info 会显示 GitHub 徽标，并可在编辑元数据对话框中修改。（#753 by @qychen2001）
- 回收站标题：回收站列表直接显示论文标题，不再只显示标识。（#754 by @qychen2001）
- CLI 云同步：新增 agentero sync（S3/R2、WebDAV）供无桌面环境使用，与桌面端共用同一同步引擎和配置，支持 status / configure / test / now / disconnect；同一 Vault 的桌面端、CLI 与 cron 通过跨进程锁串行，忙时快速返回 sync_busy。（#778 by @qychen2001）
- ACP 会话加载超时：历史会话加载使用独立的 60 秒预算，不再受交互请求 15 秒超时限制，Pi 等长会话恢复不再频繁超时。（#779 by @JiaheChen2002）
- Agent 安装权限：Unix 上 Codex 及其他 Agent CLI 的 npm 安装、回退与卸载统一写入 ~/.local 前缀，避免官方 Node 安装下 /usr/local 只读导致的 EPERM；Windows 保持全局安装。（#791 by @Phil-Fan）
- Windows Skill 导入控制台：Windows 安装推荐 Skill 时，gh 请求不再反复弹出命令行窗口。（#741 by @qychen2001）
- 第三方开源声明：补充第三方开源组件的使用情况披露。（#736 by @Phil-Fan）
已知限制
- Git 同步为全量镜像：v1 尚未接入 Git LFS，也没有按论文按需拉取，PDF 与 TeX 会永久留在 Git 历史中，仓库体积由用户自行承担。（93ba55b9 by @qychen2001）

0.11.9 让 Quick Chat 和侧边栏共用同一套只读研究上下文：选区、当前论文与 @ 提及先变成最小证据，Agent 需要时再按标题摘要、章节和页面逐级阅读，并把用过的引用列为可点击来源。同时带来一轮覆盖 Agent 流式输出、PDF 阅读、编辑器自动保存与论文库的性能优化，以及双栏翻译、Windows ACP、文件树等一批问题修复。
新功能
- 只读研究上下文：Quick Chat 和侧边栏共用同一套只读上下文：选区、打开的论文和 @ 提及先解析成最小证据，Agent 通过本轮授权的 agentero-context MCP（context_search / context_read / paper_relations）按需展开，摘要和正文不会预先塞进 prompt；授权变化时自动新开会话并移交已有对话，用过的引文记入来源清单、可跳回原文。（#776 by @ffy6511）
改进
- Agent 流式渲染：流式分片按帧合并为一次状态更新，面板外壳与会话历史不再随每个 token 重渲染；滚动时引用 chip 的矩形测量跳过无变化的更新。（541914a3, 60bf8c51, e5e18305, 93f162ad, 83b1e208 by @qychen2001）
- PDF 滚动流畅度：快速滑动不再为途经页面排队字形提取（页面停留约 180ms 后才预取几何与文本矩形），上一张页面位图保留到新位图提交，翻页不再出现空白。（a9ccaa27, 9e593bbb by @ffy6511）
- PDF 面板与链接开销：页边批注与评论卡片布局按内容记忆，页面与引文链接跳过无变化的重建，翻译与侧栏面板不再进入查看器的更新路径。（f5cb62d4, 87d99303, 4efb53b8 by @qychen2001）
- 编辑器与自动保存：每次自动保存只序列化一次文档，CodeMirror 序列化延迟到落盘时机，自动保存重种不再打断编辑器 memo，Excalidraw 场景序列化并入持久化防抖；滚动完成探测只在菜单打开时运行。（5b622414, e52d6c9d, 9ee99126, 3e2aea70, 6df329b1 by @qychen2001）
- 论文库与命令面板：论文行构建缓存并稳定表头回调，EasyScholar 标签更新批量刷写，命令面板与参考文献筛选改用预计算文本。（5d311c8e, 9170400f, c1f22ea9, 2a74b851 by @qychen2001）
- 工作区与界面响应：工作区标签在无变化 patch 下保持身份，金库树派生数组保持引用稳定，设置跨窗口更新按字段合并，后台任务 hook 只订阅任务切片，选择批注徽标不再逐键触发变更。（51220633, 3914cef0, 99e1893b, aed0db79, aafe47aa, ff799cfa, 23db2a02 by @qychen2001）
修复
- 编辑器跳转与滚动记忆：大纲与链接的跳转位置不再被滚动记忆恢复覆盖。（5561f9ca by @qychen2001）
- 金库文件事件：应用重渲染时不再丢弃缓冲的文件事件，外部改动不会漏掉。（f7620c50 by @qychen2001）
已解决问题
- Windows ACP 启动：移除拒绝继承盘符环境变量的自定 Windows Job 传输层，恢复 SDK 进程启动，opencode 等 Agent 在 Windows 上可以正常连接。（#772 by @qychen2001）
- 双栏翻译滚动性能：两栏共享瓦片位图，译文测量分摊到多帧，手势结束才让另一栏跳转，双栏翻页的 CPU 占用明显下降。（#769 by @ffy6511）
- 双栏译文链接悬停：译文页上的引用与 URL 链接会显示引用卡、交叉引用预览和 URL 提示，与原文一致。（#755 by @ffy6511）
- 文件树多余 source 目录：文件树不再显示应用自建、可重建的 source/ 引用与版面 sidecar，只含这些文件的目录会被跳过。（#747 by @qychen2001）
- 文件树重命名输入法：新建与重命名输入在组字期间不再被回车 / 退出键打断，移动目标选择器同样处理。（#746 by @qychen2001）
- AtomGit 同步：发布同步改由 Release 发布事件触发，不再赌仓库镜像在构建结束时到位；发布后自动同步到 AtomGit。（#694 by @qychen2001）

0.11.8 把批注、选区和笔记块放进对话输入框，并让大模型翻译按引擎规则只出译文。同时补上 Windows 上的桌面应用检测和 Agent 进程清理，以及远程库、同步和 Linux 拖放的几处数据问题。
新功能
- 行内引用：笔记块、选区、文字批注和视觉批注可以插在输入框光标处，发送时按出现位置写成 [Annotation N]。悬浮卡片里可以改备注、看高亮和译文，视觉裁剪图可以点开放大。（#767 by @ffy6511）
- 单篇版面重解析：插图侧栏可以只强制重跑当前论文的版面解析。已打开的论文会换成新结果，不用重启。（#728 by @ffy6511）
- 嵌入字号与栏宽：外观里可以单独设置双链嵌入字号和 Markdown 栏的最大宽度，默认仍是 13px 和全宽。文档标签可以复制磁盘路径。（#745 by @ffy6511）
- Qoder CLI: 设置里可以安装和卸载 Qoder CLI。（46e9424c by @ffy6511）
- Windows 桌面应用：Windows 上可以检测并打开 ChatGPT、千问办公、WorkBuddy 和 Dsh 桌面版。这些应用标为暂不支持直接接入 Agent。（468ad573 by @JiaheChen2002）
改进
- 大模型翻译：OpenAI 兼容和 Agent 翻译使用固定引擎规则，较短的选区按词典出译文，不再追问要翻译还是解释。设置分成系统提示词和用户模板。系统栏留空仍用内置学术风格，一行短说明只作为附加偏好。用户模板用 {{text}} 放入原文。Agent 会选该会话已声明思考档位里的最低一档；没有公布档位时保持原样。占位符只认 {{targetLang}}、{{sourceLang}} 和 {{text}}。（#724 by @ffy6511）
修复
- 全文翻译与快速对话：全文翻译保留引用、交叉引用和 URL，章节标题保持原文层级。快速对话的黄框在关掉卡片后仍在，译文页上对准划中的区域。（#751 by @ffy6511）
- 视觉批注缩放与点击：旋转页缩放后高亮贴住字形。对话里单击视觉引用会放大并编辑备注，链接只滚到裁剪区并闪一下定位。页边针仍打开卡片。（#760 by @ffy6511）
- 悬停卡与页签：图表和参考文献的悬停卡可以移上去阅读，外链地址不再被系统提示截断。逐页翻译的页签在悬停时出现在页面内侧右侧。（#745 by @ffy6511）
- 笔记选择与输入法：块内第一次全选停在当前块。单独成段的双链嵌入占满一行。内容送进对话后可以直接打字。代码块语言搜索和中文会话重命名不会被错误焦点或输入法回车打断。（#744 by @ffy6511）
- 快速配置向导：重新打开快速配置向导不会把已有主题、代理、翻译服务和 API Key 写成默认值。（#731 by @Zhou-Ruichen）
- 远程库元数据：远程 Vault 会带上 SQLite WAL 里已提交的元数据。列表刷新读取服务器的一致快照，未发布的本机修改不会被盖掉。（#740 by @Winfred666）
- Linux 拖入 PDF: Linux 主窗口可以从文件管理器拖入 PDF 并导入。窗口内的文件树拖动和标签重排保持可用。（#730 by @bet4it）
- 引用裁剪：把视觉裁剪发给对话时，不再把这轮提问和回复写回批注文件。从这条批注打开的会话仍会更新它。（34624811 by @ffy6511）
- Dsh 历史：本机 Dsh 重启后可以从本地会话日志恢复标题和正文。官方接口没有会话加载能力时，标题不再退成一串 ID。（bfea439a by @JiaheChen2002）
- Windows Dsh: Windows 上的 Dsh 会选用兼容的 Node 启动，避免旧 Node 上 ACP 握手静默退出。卸载时按实际安装位置移除。（725a077a by @JiaheChen2002）
- Windows Claude: 通过 npm 安装的 Claude Code 会解析到包内的可执行文件或 cli.js，不再把 claude.cmd 交给内置适配器直接启动。（8135417f by @JiaheChen2002）
- Windows Agent 进程：应用退出、连接替换或预热超时后，Windows 上的 ACP 子进程会随连接结束被回收，不再留在后台。（9d0d48a0 by @JiaheChen2002）
- 同步请求：已经同步的 Vault 空转时只发一次远程请求，两台设备不会因为本地修改时间来回重传。坚果云按账号计数的 WebDAV 配额不再被空转占满。（3cc1a9dd by @qychen2001）

本次发布为广场带来原生 CCF 截稿面板，并为 CLI 增加 agentero ui / paper open 等外部工作区控制；论文库可从 arXiv 模板推断投稿 venue 标签，arXiv 发现新增查询式检索、语义排序与 MCP 工具。同时修复了 Agent 代理环路、双栏翻译同步与 venue 标签等一批问题。
新功能
- CCF 截稿面板：广场新增原生面板，直接读取上游 ccf-deadlines 数据，按 CCF 评级、会议官网、本地截稿时间与时区、剩余天数列出即将截止的会议，顶部提供评级多选筛选，并在每次打开时刷新。（0d44f120, cefdd696, d590c0db, 2c7483e4 by @Phil-Fan）
- 未官宣截稿推算：对尚未公布下一届的 CCF A/B/C 会议，合并上游历史届次数据推算下一届截稿（保留星期几，限定最近 18 个月、预测落在未来 12 个月内），并以「预计」角标标注，补上面板原先整条缺失的会议。（2b143516 by @Phil-Fan）
- CLI 工作区控制：新增 agentero ui open|close|window|split 命令组与 agentero paper open，可从命令行打开、关闭、新建窗口，拆分工作区面板，并在运行中的应用里打开指定论文。（579ec8f5, 5b4018cb, 0a53b7c3 by @Phil-Fan）
- arXiv 投稿 venue 标签：扫描 arXiv 源码中的 LaTeX 模板（documentclass 与样式包）并投影到论文标签：模板命中显示 #submitted:<VENUE> <YEAR>，权威发表信息替换为 #venue:；论文库标签列提供手动刷新。（be7c49ae by @Phil-Fan）
- 查询式 arXiv 发现：core 与 CLI 新增不依赖 Vault 与 embedding 的发现原语（agentero discover arxiv），按关键词做确定性排序并给出可解释的命中项，支持剔除已在库论文的新颖性过滤与 shortlist 导出。（656faf94, 507e47b6 by @Phil-Fan）
- 语义排序与 MCP 发现工具：可选地在词法得分上叠加 embedding 余弦项（默认关闭，端点失败降级为词法），并新增 discover_arxiv MCP 工具，让 Agent 直接驱动 arXiv 发现。（81f62433, 39c1d118 by @Phil-Fan）
- Agent 会话历史重命名：会话历史行新增悬停改名入口，标题作为本地覆盖持久化，不再被 ACP 的会话更新覆盖。（459aa4e4, 4d426ce8 by @ffy6511; Fix #710）
- Markdown 划词行号：Markdown（Plate）划词后计算磁盘行号，随引用 chip 与提示词携带 (lines A-B)，与 CodeMirror 一致，Agent 输入框的引用 chip 也显示行号。（50e063d5, 1ebc6ba2 by @ffy6511; Fix #709）
- 广场来源浏览状态恢复：关闭并重开 Cool Papers / ModelScope 标签时恢复站内路径、前进 / 后退历史与滚动位置，Cool Papers 还会重放此前已请求的 Kimi 总结。（#716 by @Kokeip）
- MCP Vault 搜索：内置 MCP server 暴露 vault_search，复用 Host 的 Markdown 关键词搜索，PAPER.md 命中可返回 1-based 物理页码与元数据筛选。（#708 by @Zhou-Ruichen）
改进
- 机构代理学校预设：机构代理前缀旁新增已验证的 WebVPN 网关预设下拉（ZJU、USTC、XJTU 等），选择即填入前缀并切换网关类型；测试状态改用统一探针圆点，并移除冗余说明文案。（672c846f, 6f5d3187, 9a2322d2, ec03061d by @Phil-Fan）
- EasyScholar 密钥入口：设置中 EasyScholar 密钥旁新增外链按钮，直接打开签发密钥的开放 API 页面。（1aeee33f by @Phil-Fan）
- 发现结果缓存按参数隔离：广场推荐缓存改为按来源 / 模型 / top_n / 分类散列的多行表（schema v8），修复切换 embedding 模型或来源后仍复用旧结果、以及更大 top_n 返回更小列表的陈旧问题。（23dbba9c by @Phil-Fan）
- CLI 复用共享机构代理：无头 CLI 启动时读取共享设置中的机构代理，使 import id 与 paper download 与桌面端使用同一网关配置。（d87bf4dd by @Phil-Fan）
修复
- Agent 代理绕过本地回环：向 Agent 注入代理环境变量时合并 NO_PROXY=127.0.0.1,localhost,::1，修复开启网络代理后 opencode 无法通过本地回环启动、模型列表为空的问题。（f832d2cd by @Phil-Fan; Fix #638）
- 双栏翻译与版面分析同步：版面分析未完成时从翻译面板进入共享布局队列（给出排队 / 取消提示），并把源文档的版面结果镜像到翻译页，修复过早打开翻译面板会永久停留在空白的问题。（47528699 by @Phil-Fan）
- 翻译显示模式接线：翻译设置改为写入 translate.displayMode（overlay / dual pane），替换已废弃的布尔开关，修复开启双栏后不生效的问题。（fc31b273 by @Phil-Fan）
- venue 标签排除预印本仓库：将 arXiv、bioRxiv、OpenReview 等仓储型 publication 视为无 venue，落到模板推断路径而非生成 #venue:arXiv (Cornell University)，并清理旧的仓储派生标签；模板 venue 标签显示为 "Submitted to …"，#venue: / #submitted: chip 去掉命名空间前缀。（34a21efc, 7310a7fe by @Phil-Fan）

本次发布聚焦 PDF 阅读与全文翻译体验：翻译高亮与批注可以按句锚回英文原文，引用与图表交叉引用支持悬浮预览，并新增滚动方向与页面布局设置。同时带来机构代理下载、Zotero 集合引用、MiMo Code 和可配置决策 provider 等能力，并集中修复了一批 PDF 版面、Markdown 阅读性能与 Agent 相关问题。
新功能
- 机构代理下载付费 PDF: OA 链路全部未命中时，可用 EZProxy/WebVPN 前缀重写并带上用户会话 Cookie，凭机构订阅权限获取正文；设置中可配置前缀并"测试连接"。（#685 by @dengfeng-0908）
- 翻译高亮按句锚回原文：全文翻译按句对齐，在译文上高亮或批注会锚定对应英文句子，切回英文时高亮这些句子的字形。（#690 by @ffy6511）
- 引用与交叉引用悬浮预览：结构化引用未命中时，依据 PDF 目标坐标和文字矩形回退定位参考文献条目并生成裁剪预览，同时支持图表、表格、公式交叉引用预览。（#707 by @bet4it）
- PDF 滚动方向与页面布局设置：设置 → 通用新增连续滚动方向（竖直/水平）和页面布局（单页/双页跨页），写入 Host settings.json 并广播到已打开的 PDF 视图。（534a5aa6 by @Phil-Fan）
- Zotero 集合引用与迁移元数据：侧栏展示 Zotero 集合引用，保留迁移得到的集合元数据，并说明条目类型被忽略的原因。（#637 by @JiaheChen2002）
- MCP 正文读取开关：新增默认关闭的 paper_text_get MCP 工具，需在设置中显式开启后才向外部客户端返回论文正文。（c333e103 by @dengfeng-0908）
- MiMo Code Agent: 新增 MiMoCode（mimo acp）模板，并补齐静默安装/更新/卸载与版本检测生命周期；移除 OpenClaw 预设。（#683 by @dengfeng-0908）
- 可配置决策 provider: 决策层从 jEV 专用传输泛化为可配置的 System One provider，支持 jev/clef/openai/custom 预设、endpoint 与模型选择。（003b7301 by @Phil-Fan）
- 在终端打开 Agent CLI: 设置中可一键在终端打开已安装的 Agent CLI，方便未登录时直接执行登录。（4449fcce by @Phil-Fan）
- 不支持的桌面应用检测：设置 → Agent 新增只读的"本地桌面应用"区，探测 ChatGPT、千问办公、腾讯 WorkBuddy 等不支持 ACP 的应用；onboarding 同样列出并标注"暂不支持"。（614cffc4 by @Phil-Fan）
- 命令面板搜索标签与别名：快速打开现在可搜索论文标签与笔记别名。（91afe559 by @Phil-Fan）
改进
- Markdown 阅读性能：长笔记在未聚焦时跳过屏外块的布局与绘制，按文档裁剪 remark 插件，仅在触发语法存在时运行预处理，明显降低打开、滚动与侧栏拖拽的卡顿。（#702 by @Phil-Fan）
- PDF 选择与首屏性能：文本选择改为按指针意图惰性装配，并预取可见页选择几何，避免打开文档即整篇触发 PDFium 几何计算。（#606 by @Phil-Fan）
- 设置通用面板分组：设置 → 通用拆分为论文库 / PDF 阅读 / 广场 / 网络 / 集成等分组，各面板统一使用分组标题。（09452b5a by @Phil-Fan）
- 笔记导出水印默认开启：导出笔记默认带 Agentero 水印，导出对话框可单次关闭，移除冗余设置项。（1bc29c64 by @Phil-Fan）
- GitHub 下载代理预检：CLI 安装与应用更新下载前检查代理，未配置时给出可跳转到网络代理设置的可操作提示。（6ba47f04 by @Phil-Fan）
- 侧栏 Paper Info 自动隐藏：Paper Info 仅在有论文标签页或悬停论文库行时显示；悬停时可预览该论文元数据。（#695 by @Phil-Fan）
- AtomGit 发布同步更稳：以"连续无进度"判定中止而非固定时长，并把 job 上限提高到 180 分钟，修复大附件在低速链路上必然超时的问题。（#694 by @Phil-Fan）
- Antigravity 品牌图标：为 antigravity-acp 补上品牌标识，不再回退到通用终端图标。（f72db937 by @Phil-Fan）
修复
- MinerU 图片丢失：缺少或跨页图注不再导致整图从 Figures 侧栏被删除，接入真实图注几何并支持旧缓存的本地恢复。（#705 by @llamapw）
- 版面同行词序与文字层持久化：同一行文字按字形底边排序，修正加粗或更大字号的词被排到左边的问题；文字层抽完写回并标记，重启不再整篇重读。（#703 by @ffy6511）
- PDF 链接不再误入批注选中：链接交互归还给链接层，点击引用或外链不再进入批注调整框，外链统一由 Host opener 打开。（#699 by @bet4it）
- 翻译滚动保持横向位置：查看译文时滚动不再让原文横向滚动条跳到别处。（a52b67c7 by @JiaheChen2002）
- Linux 原生滚动条遮挡：弹层打开时隐藏背景页面原生滚动条，关闭后恢复，弹层内部的滚动条保留。（#693 by @bet4it）
- 内联公式渲染与对齐：新插入的行内公式不再因惰性渲染而空白，恢复基线对齐，并支持提交时把 $|$ 转换。（9bab8b5f, 659802af by @Phil-Fan）
- opencode 2.0.22 模型目录：修复新版 opencode 分两次推送模型目录时自定义模型列表被覆盖的问题。（#638 by @Phil-Fan）
- Zotero 忽略条目上报：迁移时明确上报被忽略的条目类型。（9558e1b2 by @JiaheChen2002）
- 翻译失败提示：全屏翻译失败提示新增"打开翻译设置"操作。（5c82f693 by @Phil-Fan）
- Onboarding Agent 步骤滚动：Agent 步骤改用统一的滚动容器，新增卡片不再把内容顶出对话框。（24c9f467 by @Phil-Fan）
安全性
- 依赖告警清理：升级 dompurify、katex，并通过 pnpm override 将 undici、hono、ip-address、proxy-addr、source-map-js、postcss-selector-parser、brace-expansion 等传递依赖锁到补丁版；Rust 侧将 rustls 升级到 0.23.45。（334b9e51, 4cd74e8e by @Phil-Fan）

本次发布围绕翻译、PDF 批注与 Agent 接入三块：重新加入 CNKI 免费翻译引擎（含按句分块、断线重试与通行 Cookie 处理），并让内置翻译也显示探针状态；PDF 批注卡操作改为边缘标签、批注评论支持 Markdown，带标记 PDF 导出明显提速；Agent 侧在缺少 npm 时提供一键安装 Node.js，登录命令改用绝对路径。同时修好版面解析的设置引导、坚果云 WebDAV、Grok 断线重发、Excalidraw 粘贴图片等问题。
新功能
- CNKI 免费翻译引擎：把 CNKI 翻译（词典）重新接回为免费引擎，按句分块、AES 加密请求并缓存 token，新增断线重试与通行 Cookie 处理，批量翻译不再中途成片失败。（#664, 44d84c14 by @Phil-Fan）
- 一键安装 Node.js: Agent 安装/更新依赖 npm；当系统缺少 npm 时，失败提示直接提供「安装 Node.js」入口，并通过后台任务显示进度、支持取消，Windows 下安装后无需重启即可识别。（67c4d7e1 by @Phil-Fan）
- CLI 导入本地 PDF: agentero import pdf <file>... 支持批量导入本地 PDF，执行 LiteParse 探测、Zotero 识别与 DOI/arXiv 元数据解析后按规范 ID 归档，并可指定目标目录或跳过识别。（#644 by @bet4it）
- 低频配置提醒：首次进入时，对「本地 ONNX 版面分析占用内存/CPU」和「网络代理」等需要配置的功能弹出右上角提醒，可一键跳转到对应设置并选择「不再提醒」。（#658, b69578a8 by @Phil-Fan）
- 翻译卡钉住：翻译卡可用 Esc、点击外部或关闭按钮收起；需要回顾的译文可钉在原文旁，通过页边标记再次打开，取消钉住后关闭即丢弃。（#667, #680 by @qup1010）
- 学术检索 BYOK: Semantic Scholar、PubMed、OpenAlex 支持通过环境变量配置可选凭据，默认行为不变，仍走免费端点。（#649, #651 by @dengfeng-0908）
- 批注评论 Markdown: 高亮与视觉批注的评论在 PDF 批注卡和笔记嵌入中按 Markdown 渲染，长评论保持可滚动。（#661, #662 by @Kokeip）
改进
- 版面解析设置引导：把「OpenAI 兼容」折叠进「其他提供商」并提示优先使用 Paddle / MinerU；解析或版面分析失败时，提示可直接跳转到分析设置。（#656, f736dc0a, acc8fb2a by @Phil-Fan）
- 带标记 PDF 导出提速：替换 EmbedPDF 保存路径中逐字节拷贝 WASM 堆的循环为一次性切片拷贝，多兆文档导出明显加快，并在完成时给出成功提示。（#595, 69efc507 by @Phil-Fan）
- 批注卡操作改为边缘标签：批注卡操作改为垂直边缘标签，操作栏移出滚动区域，不再遮挡正文或因滚动被裁剪。（3812e96a, da760eae by @Phil-Fan）
- 内置翻译探针：内置（agentero）翻译在默认服务下拉中也会发送一次真实请求显示探针状态，网关不可用时明确显示失败。（#647, aa825196 by @Phil-Fan）
修复
- 坚果云 WebDAV: 支持坚果云帐号根地址 https://dav.jianguoyun.com/dav/，并校验探测写入，避免连接测试通过而首次同步才报 404。（#681, 973fce12 by @qychen2001）
- Grok 断线重发：会话连接在 prompt 送达前断开时丢弃该进程并用 session/load 重发同一 prompt，避免上下文丢失。（#675, 1fba75fe by @ffy6511）
- 空批注失焦取消：点击图片产生的空批注在失焦、点击外部或 Esc 时取消，不再残留草稿与选区。（#673, 0f36b304 by @ffy6511）
- 含空格的 PDF 引用：打开路径含空格的 PDF 引用链接时正确解码并跳转。（#665, 5720c936 by @ffy6511）
- 划词复制交互：复制后按钮变为对勾并保留选区，不再因弹出提示打断连续划词。（#648, e6ca1506 by @ffy6511）
- 批注编辑器快捷键：PDF 批注输入框内 Ctrl/Cmd+B 与 Ctrl/Cmd+I 正常加粗、斜体，不再误触文件栏切换。（#669 by @Kokeip）
- 选区批注输入框：固定的选区作为批注摘要统一展示，不再作为隐藏 chip 混入输入框遮挡占位符。（#660 by @Kokeip）
- Library 列拖拽：拖动 Library 列头不再被误判为文件路径拖拽而分裂工作区。（#646, 79045950 by @Phil-Fan）
- 紧凑 Figures 面板：紧凑面板下重新提供 bbox 叠加层开关，并让提醒提示按行堆叠、操作按钮不再挤压长文案。（#653, 1e5a33aa, b331339e by @Phil-Fan）
- Excalidraw 粘贴图片：支持把剪贴板图片粘贴进 Excalidraw 并随文件保存，同时把文件树剪贴板快捷键限制在文件树表面。（#682, 598a88a9, ef292f1d by @Phil-Fan）
- Agent 登录命令：登录终端按合并后的 PATH 将可执行文件解析为绝对路径，修复 bash -lc 读不到 zsh 配置导致的 command not found；并移除内置 Claude/Codex ACP 的冗余探测行。（#686, 3dcb669b, f57313b3 by @Phil-Fan）

本次发布围绕 PDF 阅读、Library 与 Agent 接入三块改进：/Rotate 旋转页面恢复按显示方向正立渲染，划词高亮更贴合文字并新增一键复制；Library 支持编辑标签颜色、拖动并记忆列宽、按加入日期排序，还能自动收纳 papers/ 下的自定义文件夹；Agent 侧新增 Antigravity 官方预设，修复 Windows 内置 ACP 与 OpenCode 2 自定义模型目录，并可用 @ 一次引用整份 arXiv 每日推荐。工作区布局持久化、Vault 侧栏稳定性与移动端构建也一并修好。
新功能
- PDF 划词复制：PDF 划词工具栏新增「复制」按钮（macOS 为 ⌘C），放在翻译之后；点击后复制选中文字、收起划词菜单并清除选区。（#640 by @bet4it）
- Antigravity 官方预设：Agent catalog 新增 Google Antigravity ACP 预设，安装、更新、卸载沿用设置页既有流程；版本与平台压缩包直接读取官方 ACP Registry，不硬编码、无旧版本回退。（#629 by @Zhou-Ruichen）
- 整份 arXiv 每日推荐：@ 菜单新增「今日推荐（N 篇）」条目，一次把当日推荐摘要目录交给 Agent；需要深读时模型可请求最多 3 篇全文，前端自动续轮给出最终报告。（#626 by @ForeverHYX）
- Library 标签颜色：可以直接在 Library 修改已有标签的颜色，颜色随标签元数据保存，侧栏与论文信息面板同步显示。（#642, 84ccc2dd by @qychen2001）
- Library 列宽记忆：Library 各列可拖动调整宽度，并随设置持久化，下次打开保持上次比例。（#612, b0178408 by @qychen2001）
- Library 排序：支持按「加入日期」排序，可在表头切换。（#620, 8d1a207c by @qychen2001）
- papers/ 自动收纳：放进 papers/ 下的自定义子文件夹会被自动识别并收纳为论文——主 PDF 改名为 {id}.pdf、附件归位、写入 NOTES 壳、登记 Catalog 并触发后台元信息识别；失败不会删除用户目录。设置里的 autoIngest 开关默认开启，应用关闭期间新建的文件夹在下次启动时补收纳。（#549, 424ef5f2, 4ac91fd6 by @Phil-Fan）
- OpenCode 2 模型目录：当 OpenCode 2 同时返回不完整的 configOptions 与更完整的原始模型目录时，改用更完整的目录解析，自定义 provider 的模型重新出现在模型选择器；并升级到 OpenCode v2。（#638, a1665652, 88418fe4 by @Phil-Fan）
改进
- 布局持久化：手工调整的侧栏与分屏比例会按布局记住并在重启后恢复，修复切换布局、打开 Agent 或点击侧栏后宽度回退到默认的问题。（#624, 17416e9d, 9bb8c238, 55351c5a by @qychen2001）
- PDF 与笔记分屏比例：打开或关闭笔记分屏后保持 PDF 与笔记的比例，不再被重置。（a6a46391 by @qychen2001）
- Library 常驻首位：Library 标签固定显示在标签栏第一个，不再被其它标签顶到后面。（#631, 486c5fd3 by @qychen2001）
- 论文路径面包屑：阅读 PDF 时在面板顶部显示可跳转的论文路径面包屑，悬停可预览候选、点击可返回 Library 对应位置。（#613, efe00580, 560d276c by @Phil-Fan）
- OpenAI 兼容翻译：补充自定义 OpenAI 兼容翻译服务的配置说明，明确端点填写方式。（#621, 0c620050, 2c6d2f2e by @Phil-Fan）
修复
- PDF 旋转页面：修复 /Rotate 页面被按未旋转尺寸布局与切图、导致横向表格竖排错位并溢出重叠的问题，页面按显示方向正立渲染。（#604, 6d074dfd, 9a7dcaee by @Phil-Fan）
- 划词高亮边界：高亮批注改用紧致字形边界，不再纵向溢出到相邻行或相互重叠。（#639 by @Immortal-Fates）
- 删除翻译卡后重现：删除翻译卡后，迟到的 provider 回调或已开始的写盘不会再让结果重新出现；普通切换卡片不会取消后台完成。（#627 by @Zhou-Ruichen）
- Windows 内置 ACP: 规范化带 \\?\ 前缀的适配器入口脚本路径，修复 Windows 安装版内置 Codex ACP 在初始化前退出、无法连接的问题。（#633 by @llamapw）
- hermes 模型选择器：兼容旧的顶层 models 字段，并把重型 Agent 的 warm session/new 预算放宽到 30 秒，修复 hermes 模型列表为空、无法选模型的问题。（#628 by @Zhou1317fe5）
- Vault 侧栏黑屏：去掉整条侧栏的合成层，修复打开论文、切换标签或导入后侧栏整片变黑、需要滚动才恢复的问题。（#607, d341fe27 by @Phil-Fan）
- 划词浮层误触布局：划词工具栏与问答卡打开时冻结 Dockview 的标签/分组拖拽，避免在标签栏上的拖动把布局误分成多栏，标签点击不受影响。（#608, a3c80932 by @Phil-Fan）
- 远程访问连接：更新中继（relay）端点，并让远程端发布的目录快照保持一致，修复移动端配对时 bridge 连接失败。（#619, 45871f8d, cf9b4730 by @Phil-Fan, @qychen2001）
- 移动端构建：广场缓存论文的 PDF 解析在 iOS/Android 上被编译剔除后不再导致构建失败，修复 v0.11.3 的 Android 与 TestFlight 构建；已有缓存副本仍可复用。（83cb906e by @Phil-Fan）
安全性
- Markdown 依赖：升级 platejs 及 lockstep 的 @platejs/core 到 53.3.14，修复 HTML 反序列化安全公告（Dependabot #49）。（4f05d2c4 by @Phil-Fan）

这次发布让 Agent 能直接阅读广场上的论文全文，并补上论文的月/日出版日期、常驻 Library 标签，以及论文目录之外的 Vault 文本读写。阅读布局、划词翻译和 PDF 选区也更稳定；论文重命名、标签恢复和聊天附件里的几处会中断操作的问题一并修好。
新功能
- 广场论文全文：在 Agent 输入框用 @ 引用 arXiv Daily 或订阅源里的论文后，应用会把 PDF 下载到 Vault 之外的缓存，转成只读全文再交给 Agent。准备失败时退回摘要，不会把论文写进 Vault；设置 → 关于可以查看并清除这块缓存。（#589 by @ForeverHYX）
- Vault 文本读写：外部 Agent 可以通过 MCP 列出、读取和写入 papers/ 之外的 UTF-8 文本，例如 LaTeX 草稿。隐藏的应用数据、二进制、NOTES.md 和布局索引不在这条路径上。（#602, ae42bbdd by @Phil-Fan）
- 出版日期：论文时间从只有年份改为按来源精度保存 YYYY、YYYY-MM 或 YYYY-MM-DD。Library、论文信息、元数据编辑、MCP 和 CLI 都显示这个日期，Library 默认按它从新到旧排序。（#599, 908cd333 by @qychen2001）
- 常驻 Library: Vault 打开期间 Library 标签一直在，不能被关掉；逐标签固定功能一并移除。（#609, 9460702d by @qychen2001）
- Claude Code 技能目录：当 claude 在 PATH 上、且 Vault 还没有自己的 .claude/skills 时，会把该目录链接到 .agents/skills，让 Claude Code 看到 Vault 里的技能。已有的真实目录不会被替换。（#563, 51f5ff69 by @qychen2001）
- 划词翻译卡片：翻译卡片随内容增高，长段落可以一次读完；只有超出卡片或窗口时才滚动，流式结果默认跟着底部走。（c9288708 by @JiaheChen2002）
改进
- Agent 栏宽度：Agent 布局里聊天栏默认占阅读区的三分之一，而不再是一半。手动拖过的宽度会按布局分别记住，下次进入或重新打开应用时恢复。（7c3911e6, 140aa949 by @qychen2001）
- 阅读与笔记布局：阅读布局和笔记布局会收起左右侧栏。切换到这两种预设时，布局会保持选中，不再因为打开或关闭笔记分屏被标成自定义。（5a64e57d, f015e0c8, bb5f4e0a by @Phil-Fan）
- 自定义 Agent 说明：添加或编辑自定义 Agent 时，表单会说明它是在当前 Vault 里启动的 stdio ACP 命令，参数按空格拆分。（#611, 26f60c4c by @Phil-Fan）
- 精读图标：文件树里手动触发论文精读的图标从闪电改为笔记本笔，表示阅读并写笔记。（#605, 5dfe1ed3 by @qychen2001）
- 文件树选中态：选中行使用侧栏主色和对应前景色，悬停与按下也跟侧栏强调色走，当前文件更容易辨认。（8c3a0f9d by @Phil-Fan）
修复
- 论文重命名：重命名不再因当天已有使用记录而整段回滚；文件树里的论文行可以就地改名；已打开的 PDF 与笔记标签会跟上新的路径和标题。（#597 by @bet4it）
- 恢复论文标签：重启后恢复 papers/ 下的论文标签时，会等文件树就绪再加载，不再把带点的论文目录误判成文件并生成多余的 source/。（#622 by @Winfred666）
- 视觉批注芯片：同一条 PDF 视觉批注再次加入侧栏对话时只保留一枚芯片；删掉一枚不会把同 id 的其它芯片一起清掉。（#614 by @HuangYincan）
- PDF 选区高亮：文字选区改用更紧的字形边界和更淡的蓝色，去掉空白行和过大的矩形，行与行之间留出空隙。（#603 by @longP-666）
- 聊天图片：剪贴板图片可以粘贴进对话输入框；论文视觉卡片上的「加入侧边栏对话」在失焦后仍然可以点。（#600 by @Winfred666）
- Markdown 尖括号：笔记里编辑器不认识的标签，例如未闭合的 <Constraints>，不再把后面的正文截掉；行内代码里的 <input> 也会保留。（#623, 15ed1ac1 by @Phil-Fan）
- 划词翻译重复：滚动页面不再因为选区菜单重定位而反复翻译、在页边叠出一列相同的「文 A」。关掉翻译卡片后，对应的页边标记也会消失。（468ab365, ad5d4a78 by @JiaheChen2002）
- 选区框颜色：PDF 视觉选区和评论连线固定用默认中性色，不再跟着颜色主题变成别的颜色。（#610, 357f492a, 26dd709f by @Phil-Fan）
- 划词复制：选中 PDF 文字不再自动复制到剪贴板，也不再弹出「已复制」。（6bd82563 by @Phil-Fan）
- 语音输入：刚打开 Agent 栏就使用系统语音或输入法时，第一段文字不会被草稿同步清掉。（05b3daec by @Phil-Fan）
- 界面文案：后台任务、清除活动记录和主题名称不再把未替换的占位符、原始 i18n key 或错误的成功文案显示给用户。（56d189e4 by @qychen2001）
- 订阅错误：广场订阅和 arXiv 推荐失败时显示本地化说明，不再把 feeds.listFailed 这类内部代码直接 toast 出来。（6d679a7c by @qychen2001）
- tunnel-client 检测：之后装上 tunnel-client 时，MCP 的启动和状态会重新查找二进制，不必重启应用。（#601, 45963977 by @Phil-Fan）
- 未安装的 Agent: 缺少对应 CLI 时，内置适配器或过期探测结果不会再把它显示成可选用；PATH 上已有的适配器和已保存的注册不受影响。（57fcffb8 by @qychen2001）
- Windows 标题栏：深色主题下，Windows 标题栏会跟着应用变暗，而不再在系统浅色模式里保持白条。跟随系统时仍由操作系统决定。（#559, 6fdc0a07 by @qychen2001）
- 同步内部文件：坚果云等客户端把同步目录镜像回 Vault 时，根目录下的 blobs/、manifests/、HEAD 和 vault.json 不再出现在文件树里，也不会被再次上传。（#625, 9d678b15 by @qychen2001）

本次发布聚焦阅读与写作体验：划词即可在 PDF、Markdown 和 AI 对话中插入批注；Library 标签页默认常驻；PDF 支持导出带高亮与批注的文件；编辑器新增图片组和分栏布局；Agent 生态继续扩展，支持 MiniMax Code、Claude/Codex 内置适配器与 Dsh 新 profile；同时修复了公式渲染、翻译、LaTeX 编译、侧边栏滚动和 Agent 安装稳定性等一众问题。
新功能
- 划词批注：在 PDF、Markdown 笔记和 AI 对话中选中文字后点击「加入对话」，即可就地添加、编辑、删除批注，并支持来源定位与上下文汇总。（#580 by @Miracle-0）
- Library 常驻标签页：Library 标签页默认 pinned，不会被误关闭；标签上显示 pin 图标，右键可 Pin/Unpin；pinned 状态随布局持久化。（a2ae0f9 by @Phil-Fan）
- PDF 批注导出：可将当前 PDF 连同高亮与注释一并导出为新的 PDF 文件；导出入口位于 PDF 标签右键菜单与命令面板。（d39c30d, 4e2841c, 0f16a30 by @Phil-Fan）
- 图片组与分栏布局：Markdown 编辑器支持将相邻图片折叠为飞书式图片组，并可通过拖拽重排；新增 /columns 分栏命令与拖拽分栏布局。（8970549, 4913b7a, 0992e7e, 4f14c14 by @Phil-Fan）
- MiniMax Code ACP: Agent 目录新增 MiniMax Code ACP 支持。（0dbd0f5 by @Phil-Fan）
- Claude/Codex 内置适配器：当系统 PATH 中未安装 Claude/Codex ACP 时，应用会 fallback 到构建时内置的 JS-only 适配器，减少首次安装失败。（1b12fa1 by @Phil-Fan）
- 自定义翻译提示词：设置 → 翻译新增「翻译提示词」输入框，非空时整体替换默认学术译者指令，支持 {{targetLang}} / {{sourceLang}} 变量。（5509c8d by @Phil-Fan）
- LaTeX 多文件项目编译：编译按钮、⌘S 保存和分屏编译现在会自动解析项目根文件（magic comment / 反向扫描），避免直接编译子文件失败。（99b8874, 2ef710b by @Phil-Fan）
改进
- MCP 隧道进程治理：修复 Windows 上 tunnel-client.exe 在停止、重建或退出时泄漏的问题；启动时自动清扫历史孤儿进程。（#588 by @Zhou1317fe5）
- KaTeX 渲染加速：缓存已渲染的 KaTeX HTML，显著降低包含大量公式的 Markdown 笔记的 CPU 占用。（baf42f2 by @Phil-Fan）
- 侧边栏滚动稳定性：修复左侧栏收起/展开或选中项揭示时文件树自动跳回顶部的问题。（7ea0069 by @Phil-Fan）
- Agent CLI 状态探测：将 CLI 安装状态探测移到非主线程，避免 About 面板打开时 UI 冻结约 1.5 秒。（5f0817f by @chenjiahe）
- Zotero 导入精度：导入单个 Zotero 文件夹时不再重建整个收藏夹树，只创建选中子树。（54e5fad by @chenjiahe）
- 内部重构：统一 selection、translate、ask、dnd、wiki、fs 等模块的重复逻辑，删除 dead code 与未使用依赖，提升可维护性。（多处 by @QiyuanChen）
修复
- Agent 消息公式截断：修复流式消息落定后 remend 误把 x_{<n} 中的 <n} 当作未闭合 HTML 标签截断的问题。（d382e60 by @Phil-Fan）
- PDF 双栏翻译：修复基于 bytes 的 PDF 在双栏翻译时因 tab id 后缀变化导致翻译窗格无法打开或自动启动失败的问题。（5c35d03 by @Phil-Fan）
- Vault busy 状态卡死：修复恢复 Vault 路径在 tree 加载中途被验证清除后，busy flag 无法复位的问题。（6f256c2 by @chenjiahe）
- Agent npm cache EPERM: 修复 Windows/macOS 上 npm cache 被 root/sudo 写入后导致托管安装失败的问题；不可写时自动隔离到 Agentero 自有缓存目录。（1c03213, 7c76448 by @chenjiahe）
- Windows 适配器打包：修复 bundled adapter staging 在 Windows Release 构建中因 execFileSync 无法直接执行 .cmd 批处理而失败的问题；改为在 Windows 上通过 shell 调用 npm。（a5f0034 by @Phil-Fan）
- Dsh ACP profile: 迁移到新版 umbrella dsh --profile acp，解决旧独立包停滞在 prerelease 导致的版本不匹配。（f09ea73 by @Phil-Fan）
- 坚果云图标：设置页 WebDAV 同步提供商现在使用正确的坚果云图标。（212e297 by @Phil-Fan）
- Paper tab 恢复：修复 Vault tree 加载完成前恢复的 paper 文件夹占位 tab 被错误识别为普通目录并翻转成 Library 的问题。（93f0494 by @Phil-Fan）
- PAPER.md 检测：没有 NOTES.md 的论文文件夹现在可通过 PAPER.md 被正确识别为论文目录。（6e215f8 by @Phil-Fan）
已解决问题
- 划词批注：支持在 PDF、Markdown 和 AI 对话中添加内联批注。（#579）
- PDF 导出批注：支持导出带有高亮和注释的 PDF。（#562）
- Markdown 公式渲染性能：缓存 KaTeX 渲染结果以加速重排。（#583）
- KaTeX 公式解析错误：修复含 < 的数学公式在消息中被截断。（#584）
- 侧边栏文件树跳动：切换左侧栏或揭示选中项时不再跳回顶部。（#576）
- LaTeX 多文件编译：自动解析根文件并编译项目根。（#575）
- 双栏翻译失效：修复 bytes-backed PDF 的翻译窗格状态键错误。（#574）
- DSH ACP 错误：迁移到新版 dsh --profile acp。（#569）
- 内置 Claude/Codex ACP: 提供内置适配器 fallback。（#590）
- 自定义翻译提示词：允许用户覆盖默认翻译提示词。（#582）
- ACP 安装失败：修复 npm cache 权限问题导致的安装失败。（#542）
- Windows 卡在进入知识库：修复 Vault busy flag 在恢复路径失效时卡住。（#560）
- 笔记图片功能：支持图片组与分栏布局。（#566）

本次发布围绕 LaTeX 编辑体验的全面升级展开：全新的 LaTeX 语言引擎带来基于语法树的高亮、补全与折叠，叠加实时语法检查、chktex 规则与 IDE 风格的诊断状态栏，编译时机也改为完全由手动触发控制；同时新增 WebDAV 云同步后端与 ZCode Agent 模板，在文本编辑器中划词即可向 Agent 提问。此外修复了论文导入流水线的多个稳定性问题，以及 macOS 上首次运行 Agent 触发大量系统权限弹窗的问题。
新功能
- WebDAV 云同步：云同步在 S3 兼容对象存储之外新增 WebDAV 后端，可直接使用坚果云、Nextcloud 或 NAS 账号，设置页按 Vault 切换同步方式；同步协议与冲突合并行为保持不变，旧配置自动兼容。（#567 by @qychen2001）
- ZCode Agent 模板：Agent 目录新增 ZCode 模板，通过 zcode-acp-server 适配器接入，复用目录扫描、安装引导与设置页的完整机制，支持会话续聊与图片输入。（#572 by @ForeverHYX）
- LaTeX 编辑器引擎升级：用 codemirror-lang-latex（基于 Overleaf 的 Lezer 语法）替换旧 stex 模式，提供准确的语法高亮、环境自动闭合与缩进、前言/章节折叠，以及完整的命令、环境与数学符号补全。（commit by @Phil-Fan）
- LaTeX 实时语法检查：输入时对未闭合环境、未闭合括号、重复标签与缺失引用显示波浪线，悬停命令可查看文档；chktex 的排版规范检查叠加在内置规则之上（未安装时自动降级）；编辑器底部新增 IDE 风格诊断状态栏，按严重级别计数，悬停展开问题列表，点击跳转到对应位置。（commit、commit、commit by @Phil-Fan）
- 划词问 Agent: 在文本/代码编辑器中选中文本即弹出 Quick chat / Add to chat 工具栏，选择内容自动固定到 Agent 上下文（Cmd+L），上下文芯片与提示词携带行号范围（如 "main.tex 75-77 行"），Agent 可直接引用行号。（commit、commit by @Phil-Fan）
- 编辑器字号工具栏：文本编辑器新增字号工具栏，支持 12–20px 的加减与下拉调节，按设备持久化并跨标签页同步。（#568 by @byy-yby）
- papers/ 文献库入口：文件树将 papers/ 目录识别并渲染为文献库入口，与论文库视图衔接。（commit by @Phil-Fan）
改进
- TeX 编译时机可控：自动保存只写盘不再触发编译，编译仅在 Cmd/Ctrl+S、编译按钮或 Cmd+\ 时进行；手动触发始终强制 latexmk 全量构建，修复错误后重试不再卡在旧错误摘要；编译菜单新增「清理中间文件」操作，可重置 latexmk 的指纹数据库。（commit、commit、commit by @Phil-Fan）
- Vault 初始结构：新建 Vault 脚手架内置 data/ 数据目录与 thesis/main.tex 论文起始文件。（commit by @Phil-Fan）
修复
- 论文导入流水线：独立 PDF 导入现在校验文件有效性并主动触发元数据识别闭环，兜底标题自动去除 .pdf 后缀（不再产生 .pdf.pdf 嵌套文件）；识别重命名期间推迟解析、引文与版面任务，消除路径竞态；识别或编辑标题后 NOTES.md 的一级标题与 aliases 自动同步，且不破坏已有笔记内容。（#578 by @bet4it）
- macOS Agent 权限弹窗：本地 ACP Agent 现在以 Vault 作为进程工作目录启动，首次运行不再从根目录递归扫描而连续弹出音乐、桌面、iCloud 等系统权限请求；兜底目录严格限定在专用 scratch 目录。（#573 by @HuangYincan）
- PDF 缩放漂移：Ctrl/Cmd + 滚轮缩放后页面保持水平居中，不再随缩放逐渐左移，垂直阅读位置保持不变，Agent 侧栏挤压查看宽度时同样稳定。（#565 by @longP-666）
已解决问题
- LaTeX 文件路径补全：在 \input、\include、\includegraphics、\bibliography 等命令的参数中补全 Vault 内的文件路径，目录优先展示并逐级深入，支持本地与远程 Vault。（#577、commit by @Phil-Fan）
Full Changelog: https://github.com/poco-ai/Agentero/compare/v0.11.0...v0.11.1

本次发布围绕「在 Agentero 里直接写与读」：新增 .tex 就地编译与 PDF 预览，为普通文本、PDF 与 Excalidraw 提供轻量查看器，为网页论文带来选区工具，并显著改善 Agent 连接速度与 LaTeX 编译体验。
新功能
- TeX 就地编译：文件树中每个 .tex 都有编译按钮，可选 PDFLaTeX / XeLaTeX / LuaLaTeX（由 latexmk 自动编排依赖与重跑），编译结果在编辑器右侧以 PDF 分屏打开。（#561 by @byy-yby）
- 后台编译任务：编译改为后台任务运行，任务面板实时显示 latexmk 阶段与进度并可取消；.tex 保存后自动重新编译，编译完成即刷新已打开的 PDF pane。（commit by @Phil-Fan）
- 纯文本编辑器：papers/ 之外的 txt/tex/bib/json/yaml/python 等文件改用 CodeMirror 6 打开，支持按扩展名高亮、TeX/BibTeX 补全、自动保存与外部改动重载。（commit by @Phil-Fan）
- Excalidraw 白板：.excalidraw 文件可作为可编辑画布打开，跟随主题，支持自动保存与外部改动就地重载。（commit by @Phil-Fan）
- 普通 PDF 阅读模式：papers/ 之外的 PDF（如编译产物）不再走论文流水线，关闭版面分析、批注、翻译等重功能，保留翻页、缩放、搜索、大纲与文本选择。（commit by @Phil-Fan）
- 网页论文选区工具：通过带域名白名单的 agentero-web 代理内嵌网页论文，可在页面上划词复制、翻译，并使用 ⌘K 快速提问与 ⌘L 加入对话。（commit · commit by @Phil-Fan）
- 会议论文 PDF 自动推导：新增 USENIX，以及 NeurIPS / CVF / ECVA / IJCAI / PMLR 的 PDF 直达链接推导，落地页缺少附件时也能自动下载正文。（#526 by @bet4it · commit by @Phil-Fan）
- Agent 连接复用：Chat 预热后的 ACP 连接会保留复用，避免每轮冷启动；首个 token 前会显示 starting / waiting-model / reconnecting 等阶段。（commit by @Phil-Fan）
- CLI 登录引导：认证失败时可在确认后于终端执行 Agent 模板自带的登录命令，设置页与 Doctor 也提供入口。（commit by @Phil-Fan）
- 一键安装 Node.js: Doctor 的 Host 运行时区在缺少 Node.js/npm 时提供安装按钮（Windows 走 winget、macOS 走 Homebrew），安装后自动重新探测。（commit by @qychen2001）
- 内置 Skills: 新增「科研论文写作」与「学术绘图」技能，并自动发现随应用内置的 skill。（commit · commit by @Phil-Fan）
- Plaza PPT 技能推荐：Plaza 新增 PPT 相关技能推荐。（commit by @Phil-Fan）
- ⌥A 全文翻译：工具栏的语言按钮绑定 ⌥A（macOS 上按物理键匹配），双栏翻译同样生效。（commit by @Phil-Fan）
- 引导页网络代理：首次引导新增网络代理设置步骤。（commit by @Phil-Fan）
改进
- 标签右键菜单：右键菜单显示关闭标签的快捷键提示。（commit by @Phil-Fan）
- Windows Agent 健壮性：改进 Windows 下的命令发现，并对 npm 缓存失败给出更清晰的说明。（commit · commit by @JiaheChen2002）
- 翻译卡片锚定：网页中翻译卡片固定显示在选区下方，不再漂移。（commit by @Phil-Fan）
修复
- macOS 全屏标题栏：原生全屏时折叠避让三色按钮的占位，首个控件不再被顶到约 92px 处。（#555 by @HuangYincan）
- 触控板捏合缩放：手势期间只做 CSS 预览、松手提交一次真实缩放，慢速捏合不再无响应、快速捏合不再跳格。（#556 by @HuangYincan）
- ModelScope 面板横向平移：恢复站点 1280px 布局并桥接滚轮横向滚动，同时不再裁掉左边缘。（#557 by @HuangYincan）
- 编辑器粘贴：修复编辑器内复制粘贴出现多余空行与双链别名重复，以及空标题块粘贴退化为正文。（#558 by @bet4it）
- Windows PDF 跳页：修复 Windows 上滚动时视口随机跳到首页或末页。（#545 by @langbit）
- Windows MCP 隧道闪窗：健康探测子进程加上 CREATE_NO_WINDOW，不再每 10 秒闪现控制台。（#544 by @Zhou1317fe5）
- Agent 目录检测：补上 OpenCode 的 ~/.opencode/bin 与 Grok 的 ~/.grok/bin，并在引导页说明缺失层。（#554 by @HuangYincan）
- 内置 embedding: 没有可用内置 embedding 时不再写入不可用的默认值。（commit by @Phil-Fan）
- 网页代理：代理返回时剥离上游 CSP meta，避免内嵌页面被自身策略破坏。（commit by @Phil-Fan）
- Agent 消息操作：用户消息的操作按钮改为浮动在气泡旁。（commit by @Phil-Fan）
- 依赖安全：覆盖 mermaid 依赖链中受影响的 nanoid 与 lodash-es 版本。（commit by @qychen2001）
已解决问题
- 笔记内容被截断：修复正文中出现 < 比较（如 <0.5B）时，Markdown 笔记后半段被静默丢弃。（#533 by @Phil-Fan）
- 引用悬浮卡片：内部链接跳转后自动关闭引用悬浮卡。（#528 by @Phil-Fan）
- 导入去重：修复同步去重后论文元数据与笔记不完整。（#507 by @Phil-Fan）
- Markdown 导出：导出 .md 时去掉 vault 内部 frontmatter（aliases、tags 等）。（#551 by @Phil-Fan）
- 视觉批注边缘：视觉区域边框改用主题色，深色模式下更清晰。（#498 by @Phil-Fan）
- Agent 首 token 延迟：通过连接复用与阶段提示改善 TTFT 体验。（#536 by @Phil-Fan）

v0.10.3 聚焦 Agent 引用体验、PDF 阅读器稳定性、CLI 精简和 Zotero/Windows 适配。Agent 回复现在以内联引用 pills 直接跳转到 PDF 具体区域；PDF 双面板同步、内部链接返回、布局分析进度和翻译队列都得到改进；CLI 移除了维护成本高的子命令并新增 describe/layout/cross-vault 能力。
新功能
- Agent 内联引用 pills: 将 Agent 回复中的 Markdown 链接和 vault wikilinks 解析为可点击的引用 pills，点击后通过 agent_resolve_citation 解析 PDF 坐标并跳转到对应页面、章节或图表区域。（commit by @Phil-Fan）
- Markdown 导出：编辑器新增「另存为 Markdown」功能，支持将当前文档导出为 Markdown 文件。（commit by @Phil-Fan）
- CLI 操作目录与跨库迁移：新增 agentero describe 展示可用操作；agentero layout list --kind section 可输出章节标题；agentero paper move 支持 vault 前缀的跨库论文迁移。（commits by @Phil-Fan）
- MCP 工具扩展：MCP 新增 paper_set_read、layout_list 和 layout_get 等工具，并发布操作不变量。（commit by @Phil-Fan）
- Zotero 自动发现：onboarding 与迁移对话框现在能自动发现各平台默认的 Zotero 数据目录，并在同步设置中复用该发现逻辑。（commits by @JiaheChen2002）
改进
- 论文导入源与回退链：新增 alphaXiv 源并将 arXiv/DOI/PMID 的解析改写为 hedge 回退链：多源并发、按优先级择优、失败时优先报告 rate_limited 而非空结果，提升批量导入成功率。（commit by @Phil-Fan）
- PDF 双面板滚动同步：用内容坐标替代滚动比例，直接从原生滚动事件写入位置，消除 2-3 帧延迟和中间按钮平移被吞的问题；缩放手势合并为单次落点并重新对齐。（commit by @Phil-Fan）
- PDF 全文翻译队列：在布局分析尚未完成时点击全文翻译不再报错，而是进入 waitingLayout 队列，自动在解析完成后启动文档级或页面级翻译。（commit by @Phil-Fan）
- PDF 内部链接返回：点击文中内部链接（附录、图表、引用）后，左下角出现「返回跳转前」浮动按钮，可一键回到原阅读位置；落点区域会以琥珀色高亮闪烁提示。（commits by @Phil-Fan）
- Agent 引用解析与提示：改进图/章节解析逻辑，增加失败提示 toast，并持续精简 Host prompt envelope，将引用格式下沉到 vault AGENTS.md 与 skills。（commits by @Phil-Fan）
- 远程历史会话恢复：点击远程历史项目时立即显示 shimmer 占位，待会话重放完成后再原子替换为真实对话，避免空白等待。（commit by @Phil-Fan）
修复
- PDF 拖拽处理：修复在主窗口、阅读器、文档窗口和功能窗口中拖入 PDF 的处理，优先使用原生拖放路径，仅接受本地文件，归一化 Windows 路径并去重。（#514 by @langbit）
- Workspace PDF mode 保持：修复重启后、关闭标签页重开或文档弹出时，本地 PDF 因探测缺失被降级为空 markdown editor 的问题。（commits by @Phil-Fan）
- Paper body 不再误渲染为 markdown: 当 paper 元数据和水化竞争导致探测全部失败时，不再回退到可编辑但无效的空 markdown editor，而是进入 PDF 空状态并自动重试。（commit by @Phil-Fan）
- 魔棒网页入库 URL 双重前缀：修复 translator 返回绝对 URL 导致请求被重复拼接而 404 的问题，恢复魔棒添加网页入库功能。（commit by @Phil-Fan）
- 布局分析进度显示：在 Figures 面板和后台任务中正确展示 headless 布局分析的进度与状态。（commits by @Phil-Fan）
- Markdown 公式与目录：修复块级数学公式溢出和悬停状态问题，目录按标题层级缩进显示。（commits by @Phil-Fan）
- PDF 高亮文本可选：修复使用荧光笔标注后无法再次精确选中的问题。（commit by @Phil-Fan）
- Windows 全屏与图标：显式处理 Windows 全屏行为，并按 Windows DPI 缩放应用图标，解决任务栏/Dock 中图标过小的问题。（commits by @JiaheChen2002）
- Windows CLI 安装验证：统一 Windows 下 CLI 安装验证命令，支持 PowerShell/CMD 绝对路径验证并归一化 shim 可执行文件路径。（commits by @JiaheChen2002）
- Zotero/onboarding 流程：要求先创建 vault 才能导入 Zotero，明确区分 Agentero vault 与 Zotero 源库，保持创建 vault 后仍显示 Zotero 提示。（commits by @JiaheChen2002）
破坏性变更
- CLI 子命令移除：agentero tree 以及 agentero vault use/which/info 已移除，agentero vault 现仅保留 create 与 list；已知 vault 记录在 ~/.config/agentero/config.toml 中。（commits by @Phil-Fan）
compare

本次发布主要围绕 PDF 双栏翻译阅读体验进行打磨，新增“打开新论文时替换当前标签页”的系统设置，同时修复了 Agent 行内 Composer 和高亮批注交互中的多项稳定性问题。
新功能
- 打开论文时替换当前标签页：新增系统设置，开启后点击新论文会先关闭当前标签页再打开，适合一次只聚焦一篇论文的工作流；覆盖 Host 配置、前端设置面板、i18n 及工作区行为。（#503 by @Phil-Fan）
改进
- 双栏翻译性能与同步：为翻译副面板精简插件加载，仅保留核心光栅、滚动和缩放能力，并将成对的滚动事件合并到同一动画帧，显著降低渲染开销。（commit by @Phil-Fan）
修复
- 双栏翻译滚动与缩放同步：两个独立的 EmbedPDF 提供器现在通过模块对等机制双向同步滚动比例和缩放，并重新启用翻译面板的滚轮缩放/平移，使左右两侧可互相驱动。（commit by @Phil-Fan）
- 翻译渲染与段落适配：修复翻译副面板缺少选择插件时的挂载错误；限制标题和说明文字的扩展逻辑，避免正文占用相邻空白；优化段落适配并统一 PDF 翻译排版。（commit by @Phil-Fan）
- 高亮批注 UI 稳定：保持高亮色卡重叠顺序与文本选择工具栏一致，并将已有高亮的编辑菜单按右边缘锚定，避免悬停展开时操作按钮移位。（commit by @Phil-Fan）
- 行内 Composer 与选区卡片：稳定 Agent 行内 Composer 卡片状态；截断选区芯片标题并保留页码信息；文本选择期间隐藏引用预览，减少干扰。（commit by @Phil-Fan）
- TypeScript 目标兼容：将 toSorted 替换为 slice().sort，以兼容当前 TypeScript 编译目标。（commit by @Phil-Fan）
已解决问题
- 原文及译文同步翻页：左右面板现在保持同步翻页，避免阅读原文和译文时页面错位。（#493 by @Phil-Fan）
- 翻页会自动跳回：修复翻译面板翻页后自动跳回原位置的问题。（#489 by @Phil-Fan）
Full Changelog

本次发布聚焦阅读与上手体验：PDF 缩放改为底栏滑条、批注悬停连线与高亮色卡扇出；划词自动复制并恢复「加入对话 / 快速提问」；新手引导在完成后自动进入功能导览。同时精简 CLI（移除 usage / config / completion / trash / feed，wiki 并入 doctor wiki），并移除未获官方 ACP 支持的 Antigravity 后端。外部 Agent 完成 paper-reader 精读后会按技能闭环标记已读。
破坏性变更
- 移除 Antigravity ACP 后端：Google 未官方支持 Antigravity 的 ACP，已删除社区 agy-acp 模板及其安装、版本检查、终端登录与 auth-required 引导；加载 agents.json 时会剥离遗留的 antigravity/gemini 行，避免整表解析失败。（e546373f by @qychen2001）
- CLI 命令精简：移除 agentero usage、config、completion、trash、feed；原 wiki check 并入 agentero doctor wiki。Vault 解析仍支持 --vault / AGENTERO_VAULT / 向上查找，以及 vault use 写入的默认路径。（206f6a66、83284d9f、3e9af822、136cc48c by @Phil-Fan）
新功能
- PDF 底栏缩放滑条：顶栏 +/- 百分比与底栏适应宽/页按钮改为底栏 50%–300% 范围滑条；空闲为低调灰色，悬停/聚焦/拖动使用品牌强调色，右侧工具栏保持固定。（9736b036 by @Phil-Fan）
- 批注悬停连线：悬停右侧批注卡片时，向最近高亮片段绘制可读引线，并随纸张色调调整墨色与描边，多行批注连到最近段落而非整框中点。（c500314f、3fbc31a0、fa9836c3 by @Phil-Fan）
- 高亮色卡扇出：划词工具栏高亮色改为圆形色点，悬停时向左扇出叠放，叠边加深以便区分；展开时工具栏按右缘锚定，避免挤出视口。（22775a0e、019fac74、428fb5a8 by @Phil-Fan）
- 划词自动复制与对话入口：选中文本即复制到剪贴板，并在指针旁显示「已复制」反馈；悬浮工具栏恢复「加入对话 / 快速提问」，快捷键对调后更符合常用路径，且不再把实时选区自动塞进聊天。（8004a9f6、3cb840b7、961b6faa、24bc4aa3、270b6b27 by @Phil-Fan）
- 输入框内联选区令牌：显式加入对话的选区以行内引用芯片出现在 Agent 输入框中，图标改为 Quote，发送意图更清晰。（aa235d3d、93d77429 by @Phil-Fan）
- 新手功能导览：完成引导后自动启动功能导览，覆盖论文库、Cool Papers、全文翻译、阅读论文与笔记等步骤；推荐项与默认翻译器更醒目，布局模型会提示本地性能成本。（d996541a、72a1d2a0、9e5f1bcf、#452 by @Phil-Fan）
- 论文库单击打开：论文行改为单击打开、双击复制标题/标识，减少误触与多余步骤。（f2d7baf2 by @Phil-Fan）
- Windows F11 无边框全屏：Windows 上可用 F11 切换无边框全屏，便于沉浸阅读。（ffc4b27a by @Phil-Fan）
- 打开笔记菜单显示分屏快捷键：「打开笔记」相关菜单展示分屏快捷键提示，便于左右对照阅读。（4d022568 by @Phil-Fan）
- 精读完成后标记已读：paper-reader 与 agentero-cli 技能在写完笔记后要求执行 agentero paper set-read，外部 Agent / CLI 精读闭环后 Catalog is_read 会正确更新。（#495 by @bet4it）
改进
- 发布日志更精简：单文件上限降至 2 MB，轮转为保留约 5 个文件；发布构建日志级别上限为 Info，避免 Debug/Trace 膨胀磁盘。（052cad4a、#511 by @Phil-Fan）
- 空闲 Vault 监听更省电：空闲时阻塞等待文件系统事件而非轮询；窗口隐藏/失焦时缓冲 vault:file-changed，并拉长后台树/wiki/论文库刷新防抖。（7be641f4 by @Phil-Fan）
- 后台任务显示论文标题：任务中心行优先展示 Catalog 标题，而不是文件夹 id。（039ea801 by @Phil-Fan）
- Cool Papers 笔记清洗：拉取笔记去掉文末 Kimi Web CTA；FAQ 答案嵌在 ## Q 标题下，结构更清晰。（ee24b436、307d4ab3 by @Phil-Fan）
- 暗色模式默认白纸：PDF 纸张色调在暗色界面下默认白色，避免一打开就是深色纸。（ae1ac1d8 by @Phil-Fan）
- 移除「格式化 Markdown」菜单：右键不再提供 Format Markdown，减少误触改写正文。（cd86a91e by @Phil-Fan）
修复
- 外部移动后保留论文标题：外部重命名/移动论文文件夹时重写 Catalog 路径并在结构变化时重扫，打开标签也会 remap；不再对未验证的外部重命名弹 Toast。（00d7ef1a、9f35b6c2、3c04259d、f0e37c4a by @Phil-Fan）
- 独立文档窗口热更新：「移到新窗口」的 Markdown 会监听 Vault 变更并刷新，Agent/外部编辑不再停留在旧内容。（1175fa50 by @Phil-Fan）
- 保留多余空行：Markdown 反序列化不再折叠额外空行，笔记版式更稳定。（9dcc4607 by @Phil-Fan）
- 缺 Catalog 元数据仍可开笔记：即使 Catalog 缺少该论文元数据，仍可打开对应 NOTES.md。（88e34988 by @Phil-Fan）
- 文件树拖拽残留遮罩：拖出或结束文件树拖拽时清除卡住的 dockview 放置遮罩。（d0997228 by @Phil-Fan）
- 同目录移动不再空操作：目标文件夹与当前位置相同时跳过 vault move，避免无意义刷新。（ad450681 by @Phil-Fan）

本次发布引入官方安装包可用的内置模型服务：翻译走 Hunyuan-MT、Embedding 与 PDF 正文 OCR 可零配置使用，密钥仅编译进 Host、不经 IPC、不落盘。界面侧全面对齐 Apple 风格材质与动效，论文库滚动时压缩顶栏，Agent 输入框支持内联 @ / $skill / /command 芯片与矮窗口紧凑模式。PDF 划词把「加入对话」挪到选区角标、批注轨可悬停直接编辑，并修复 Windows 启动/诊断黑窗闪烁、Antigravity 登录引导、侧栏空白与多图合并等问题。
新功能
- 内置模型服务：官方安装包可编译进 agentero 内置提供方；翻译走专用 Hunyuan-MT 模板（自动分句、不套 [[n]] 批协议），Embedding 与 PDF 正文 OCR 同样零配置。密钥只存在于 Host（option_env!），不经 IPC、不写入 settings.json；Settings / 引导在可用性查询就绪后才默认选中，无密钥构建则隐藏或禁用该项。（d50228f5、50dfa67b、3f089832、a50ef860、5080349b、a68340f2、849befec、b9cfb969 by @qychen2001）
- Agent 内联上下文芯片：@ 提及、$skill 与 /command 以行内芯片插入输入框；块级上下文芯片收进输入区旁，上方保留短标签条，悬停展开说明。（0696564f、b2b98c25、93e97f43、4e971317、5e5935f3 by @Phil-Fan）
- PDF 划词角标与批注轨：「加入对话」移出悬浮工具栏，改在选区右下角以文字胶囊显示（仅 Agent 面板打开或独立窗口时出现）；Ask 按钮改用已配置的 PDF Ask Agent 图标。右侧批注芯片悬停即可展开编辑，空内容离开后收回，指针按下时在选区被清除前创建高亮。（8dc60ebe、f01faeec、5c61a43a、4d2b336e、1c88d754 by @Phil-Fan）
- 矮窗口紧凑输入框：主窗口高度低于 600px 时 Agent 轨道强制进入紧凑模式，输入区随内容收缩，待发送队列浮在上方且不遮挡单行输入。（00c7baae、357f4212、43d8adea、409a22bd、b530c039 by @Phil-Fan）
- 消息代码块交互：Agent 回复中的代码围栏改用与表格一致的 PlainCodeBlock（悬停复制/下载、无外层卡片），并显示语言标签；Mermaid 仍走默认图示路径。（ad8c069b、656143f9 by @Phil-Fan）
- 论文标题内联公式：论文标题中的 TeX 数学片段以内联公式渲染，不再整段当纯文本。（a0a23724 by @Phil-Fan）
- 论文库滚动压缩顶栏：论文库向下滚动时粘性顶栏压缩，搜索与操作区淡出；停止滚动约 450ms 后淡入恢复，隐藏瞬间完成以避免拖影。（c6cf6eaf、bc023c43、e64dd7c8、728ef2c2 by @Phil-Fan）
改进
- 壳层与设置的材质动效：主壳与 System Settings 对齐 Apple Design——侧栏材质与滑动高亮、分组 inset 卡片、字重与字号层级、按压缩反馈，并尊重降低透明度 / 减少动态效果；默认色板改用系统灰。（f2681bad、60b0db18、b8f0c16b、cc294cdb、f9188899、c4a919ae by @Phil-Fan）
- PDF 浮动层与侧栏精简：划词菜单与翻译卡片材质/字号对齐壳层；整页翻译页签移到左缘并缩小；选区翻译卡片默认开在左侧；Paper Info 顶栏扁平化并做高度折叠动画。（f01faeec、461fc2b5、36b9f73b、2e75dca4、01008f60 by @Phil-Fan）
- 启动时软探测目录 Agent: 应用启动时对目录内 Agent 做软探测，减少首次打开聊天才发现不可用的情况。（d23c73fe by @Phil-Fan）
修复
- Windows 启动/诊断黑窗闪烁：发布版 GUI 进程在启动采集设备型号与 Settings → Doctor 探测时未带 CREATE_NO_WINDOW，会弹出可见控制台；现对 reg query 与诊断子进程统一隐藏控制台，功能与采集结果不变。（#494 by @Zhou1317fe5）
- Antigravity 登录与会话恢复：将 auth-required 映射为可操作的登录文案，失败 Toast 提供「登录」并打开带 --login 的系统终端；登录命令按合并后的 Agent PATH 解析。提示失败若含「File not found」则在同一 ACP 连接上用新会话重试一次。同时加固异构机器上的 invoke 拒绝标记与前缀错误解析。（97cff57d、377f891e、#492 by @JiaheChen2002）
- 多栏图与图注合并：图注合并改为锚定在图注附近的连通 panel 组，避免通栏图注吞掉整段竖直带、窄不可读图注抢走已有标题下的 panel；并恢复被模型误标为正文的图注候选。（e459a16d、#223 by @qychen2001）
- 入库布局抢跑：魔棒入库在本地 PDF 尚未落盘时不再入队版面分析；分析器在文件仍缺失时软跳过，避免任务面板出现「No local PDF」。（20f0826c by @Phil-Fan）
- 侧栏文件树空白：去掉逐行 translateY 合成层，并在视口尺寸变化时重同步虚拟列表滚动偏移，避免 WKWebView 下打开论文或刷新树后左侧栏空白直到滚动。（2102df10 by @Phil-Fan）
- 划词工具栏随滚动贴合：视口滚动与缩放时重算悬浮菜单与「加入对话」胶囊的屏幕锚点；选区离开视口时菜单贴边并降低透明度。拖选期间抑制引用预览，选区结束后仍可悬停 citation / crossref。（b03d1728、ad45b412、732802be by @Phil-Fan）
- macOS 主窗口最小尺寸：配置合并后恢复主窗口最小宽高，避免被错误压到过小。（e13f84d3 by @Phil-Fan）
- Cmd+A 选中壳层文案：快捷键全选不再把侧栏与壳层标签一并选中。（32a1eb50 by @Phil-Fan）
- 翻译错误码直出：仅将已知 Host 标记映射给用户，避免把 io / json / sqlite 等内部 code 原文抛进 Toast。（533a3801 by @qychen2001）

本次发布让「为什么 Agent 用不了」可以自查：Settings → Doctor 新增本机运行时、Agent ACP 连通性与网络连通性三个板块，逐个重新探测已注册 Agent 并给出失败分类、登录状态与修复提示，也能经应用全局代理探测 arXiv、GitHub、Google Scholar 等论文源是否可达。配套修复了 GUI 启动未继承登录 Shell PATH 导致 Codex 等 npm 全局 Agent 检测不到的问题。Agent 历史标题改为后台预取并以首条用户提示回退；新增 Skill 导入的 GitHub 镜像回退、按 Agent / ACP 分开卸载、About 中清理日志，已安装的 CLI 也会在应用启动时自动同步到当前版本。此外修复 PDF 高亮菜单不消失、空批注退化为高亮、MinerU 解析丢图与 Windows 路径 / 终端等问题。
新功能
- Doctor 诊断三板块：Settings → Doctor 新增「本机运行时」（Node.js / npm 版本与路径）、「Agent ACP 连通性」与「网络连通性」三个板块，未打开 Vault 也可查看。Agent 探测通过 ACP initialize 重新进行（不发送提示词），失败归类为命令缺失 / 未登录 / 超时 / 启动失败 / 协议失败 / 未知，并给出对应修复提示与每个 Agent 的登录状态；网络探测走应用全局代理，逐行显示 Baidu、Google、Google Scholar、GitHub、arXiv、Semantic Scholar 的可达状态、延迟与生效代理。（64476ae0、bf6edb6d、51903395、13027456、9f890fa7 by @Phil-Fan）
- 按 Agent / ACP 分开卸载：卸载对话框可勾选移除 Agent CLI、移除 ACP 适配器或两者，Host 侧新增部分卸载命令并把卸载信息拆成 agent / acp 两个作用域，只清理实际选中的 npm 全局包与受管目录。（c5f3fc08、08655902 by @Phil-Fan）
- Skill 导入 GitHub 镜像回退：Settings → General 可从内置公开镜像列表中选择一个，当 api.github.com / codeload.github.com 不可达时 Skill 发现回退到该镜像；不改变输入识别方式与网络代理语义。（38741ad3、eec88ba1 by @Phil-Fan）
- 清理日志：Settings → About 新增「清理日志」，删除已轮转的归档日志，并在文件被占用时截断当前 agentero.log。（16612fdb by @Phil-Fan）
- CLI 随应用自动同步：应用内更新只替换 GUI 包，会让已安装的 CLI 停留在旧版本；现在主窗口启动时若检测到已安装但版本落后的受管 CLI，会重新执行安装（下载 + sha256 校验 + shim 刷新）。成功时静默，失败给出 Toast，开发模式与未安装 CLI 时跳过。（9e5173ca、#485 by @qychen2001）
改进
- 升级入口按需出现：Agent 的「升级」按钮只在确有可用更新时显示——用本地 detect --version 对比 npm latest（或 dsh 固定版本）；探测中、探测失败与无法判定的条目（如 Hermes）不显示升级。（44e89da3 by @Phil-Fan）
- Doctor 呈现与就地报错：Host / Agent / Vault 检查失败改为在各自卡片内展示，不再弹 Toast，诊断信息保持在上下文中；Agent 探测期间显示骨架屏而非闪现「无 Agent」空态；Agent 卡片改为版本在上、路径在下的双列布局并去掉健康态冗余的 Ready 标签；Host 卡片不再展示 npm 全局 prefix（仍用于 PATH 探测）；Host 检查改走类型化 specta 绑定，Node / npm 正常时不再误报「Host command failed」。（fdd46258、dedf8593、67beed2e、5f0a0970、0f59f18c by @Phil-Fan）
修复
- Codex 等 Agent 检测不到：GUI 启动的进程不继承登录 Shell 的 PATH，npm 全局安装的 Agent CLI 因此找不到，npm shim 即使被扫描到也可能因子进程环境中缺少 node 而无法执行。现按「描述符 → 进程 → 登录 Shell → 常见 GUI 缺失目录」顺序合并出有效 PATH，注册表扫描、可用性检查与 ACP 子进程统一在该环境中解析命令；Doctor 也会先跑目录自动注册扫描再探测，PATH 上已安装但未入库的 Agent 不必先进 Settings → Agent 或聊天才可见。（5fe0eb36、8704cddc、#488 by @Phil-Fan）
- 历史会话标题被 id 前缀占位：导入会话合并时不再用 session-id 前缀填充空的 ACP 标题，历史列表也不再固定追加 ses_…，使首条用户提示的回退生效；同时在后台预取所有无标题历史行（不设 5 秒预算）并把标题缓存到 localStorage，抽屉打开时补完剩余加载，Kimi 一类不返回标题的 Agent 无需逐条点开即可看到用户提示。（564df98d、0fe918c0、11126d5e、#484 by @Phil-Fan）
- 高亮悬浮菜单不消失：EmbedPDF 只在指针精确落在 pointer-provider 表面时才取消选中，而该表面通常被子层覆盖；在高亮批注菜单上增加捕获阶段的 pointerdown 监听，点击菜单外部即取消选中。（03a1a8c8、#490 by @Phil-Fan）
- 空批注退化为高亮：点击批注后未填写内容时，删除新建的空 PDF 笔记，而不是留下一个没有正文的高亮。（09222164、#491 by @Phil-Fan）
- MinerU 解析丢图：保留 MinerU 输出中的 images/ 资源并与 PAPER.md 一同落盘，支持带任务目录前缀的结果 ZIP；写入前校验归档条目与输出路径，避免越界写入。（#487、#467 by @LinusQiu）
- Windows 路径与终端：文件树复制路径与最近知识库列表不再暴露 \\?\ 前缀，「在终端中打开」也不再把扩展盘符路径误判为 UNC；显示与复制共用同一套路径格式化，内部文件读写路径保持原样。CMD 通过隐藏的 start 启动器创建独立交互控制台，目录经进程工作目录传入，支持中文、空格与 &、% 等字符，并避免继承桌面进程的标准输入输出导致终端闪退。（#486 by @Zhou1317fe5）

本次发布围绕 PDF 双栏翻译、Agent 对话体验与学术数据源展开：版面翻译可在工作区分屏对照阅读并双向滚动同步；Agent 将推理 / 计划 / 工具折叠为思维链，消息表格支持复制与导出，内置目录从 Gemini CLI 切换为 Antigravity；文献库新增引用数列，并接入 PubMed 与 bioRxiv / medRxiv。同时修复重启后 NOTES 面板缺失、版面翻译截断或不完整、以及长时间运行后更新装到旧版本等问题。
新功能
- PDF 双栏翻译：开启设置后可在工作区以分屏标签对照原文与版面翻译，双栏双向滚动同步；也可在独立功能窗口中打开翻译视图，设置项会持久化到 Host。（92b903ca、5550bbd5、80ebab45、e76cef5a、#466 by @Phil-Fan）
- Agent 思维链对话 UI: 将推理、计划与工具调用折叠为统一思维链，流式过程显示紧凑活动行与耗时；悬停展开、错误态徽章与回复思考动画一并整理，对话更易扫读。（357773af、6c853e34、644c04d4、#480 by @Phil-Fan）
- 消息表格操作：Agent 消息与推理内容中的表格以 PlainTable 渲染，支持复制、下载与全屏查看。（b6e268f6、94677463 by @Phil-Fan）
- Antigravity CLI: 内置目录以 Antigravity（agy-acp）取代 Gemini CLI，并迁移旧注册项；安装 / 更新 / 卸载走 npm 适配器路径，文档同步更新。（d7d7f95d、67e49716、#468 by @Phil-Fan）
- 推理强度选择：在模型选择器标题行直接选择 ACP thought_level / reasoning effort，按 Agent 记忆显式选择，未指定时回退到最高可用档。（e100f3b0、bd8bd6ca、#470 by @qychen2001）
- 文献库引用数：论文库表格新增引用次数列，便于按影响力扫读与排序。（2056aa02 by @Phil-Fan）
- PubMed / bioRxiv 数据源：学术检索与入库新增 PubMed 与 bioRxiv / medRxiv，并支持多源 ApiPaper 合并与按 scope 的标题检索融合。（d92cad0c、9c010212 by @Phil-Fan）
改进
- 侧栏自动发现 Agent: 扫描目录时自动注册 PATH 上已安装但尚未入库的 Agent，并在打开侧栏时探测，无需先进入设置才能看到可切换列表。（e598aa48、a48ffb0d、#482 by @Phil-Fan）
- 历史与切换体验：历史列表去掉空会话并在无记录时给出空状态；Agent 选项按字母排序；切换 Agent 不再插入系统提示，回复气泡也不再重复展示身份标签。（cb0de6e9、0c7612c6、19904af3、aa17a9e4 by @Phil-Fan）
- 不支持的 Agent 说明：文档与 Vault 新手笔记明确：Codex 桌面版与 WorkBuddy 目前不能作为应用内 ACP Agent 直接使用（Codex CLI + codex-acp 仍可用）。（700fba77、09aa5cf5、#473 by @Phil-Fan）
修复
- 登录 Shell / 中转站 ACP: 本地 ACP 子进程合并登录 Shell 环境变量，修复依赖用户 shell 配置（如中转站代理）时连接失败；Agent 工具安装生命周期也会带上设置中的代理。（21b89633、6e76b7ed、#478 by @Phil-Fan）
- 重启后 NOTES 面板缺失：布局恢复后若标签状态与 dock 脱节，或占位标签首次点击只激活未补开笔记，会按阅读布局重新打开 NOTES 伴随面板。（#476 by @bet4it）
- 版面翻译完整与可重试：保留完整源文本、超大块安全切分并按单元重试；部分成功保留、显式 partial 状态，并拒绝不完整的 OpenAI finish_reason 以便缩小块后重试，避免覆盖层裁切与过期任务覆盖新结果。（#477 by @jiah0231）
- 更新装到旧版：安装更新前重新检查远程签名清单，长时间运行的会话也会拿到最新版本，离线时回退到缓存清单。（7b843c14、#481 by @qychen2001）
- 历史会话范围与标题：Agent 历史只显示当前 Vault / 目录下的会话；无标题时回退到首条用户提示，不再露出会话 id 前缀。（2664acf5、#483、#484 by @Phil-Fan）
- 提示词显示噪音：用户提示展示与选区回填会剥离 harness reminder 与上下文块，只保留可读正文。（e39fb00f by @Phil-Fan）
- 双栏翻译同步：加固双栏初始化、PDF 字节拷贝与滚动同步，翻译标签激活时刷新 sidecar，并复用源栏版面结果。（b008df5b、aa42fda9、b4bf7440、2a785db0 by @Phil-Fan）
- pi-acp 与宿主同步：更新 pi 宿主时保持 pi-acp 适配器版本一致，避免 ACP 调用失配。（4909b0f7、#471 by @Phil-Fan）
- 推理列表缩进：修复思维链推理内容中列表缩进丢失的问题。（e856ec07 by @Phil-Fan）

本次发布围绕更舒适的阅读与更聪明的文献库展开：PDF 新增纸张色调（羊皮纸 / 护眼绿 / 暗色）与按住中键或空格的抓手平移，并修复中文 PDF 字体渲染；文献库接入 EasyScholar 期刊分区与影响因子标签，文件树多选批量操作移至固定侧栏头部。同时修复 Windows 上自定义 ACP Agent 启动失败与终端工具卡死两大可靠性问题，后台任务统一收敛到 JobCenter，标题检索并行提速约一半。
新功能
- PDF 纸张色调：底栏切换扩展为四档调色板（白纸 / 羊皮纸 / 护眼绿 / 暗色）；浅色色调以正片叠底方式着色，白纸落在目标色、黑字保持纯黑、插图不失饱和度，全文翻译覆盖块跟随当前色调。（01722f49b by @qychen2001）
- PDF 抓手平移：按住鼠标中键、或按住空格加左键即可 1:1 拖拽平移页面；悬停的阅读器获得空格所有权，WebKit 丢失指针捕获时拖拽依然存活。（2078cac0、1d015b18f、a10cb297b、a0ed08ed1、#456 by @Phil-Fan）
- EasyScholar 分区与影响因子：设置页配置 EasyScholar Key（带连通性状态点）后，在文献库标签列头一键为当前范围论文批量写入期刊分区、IF/IF5/JCI、SCI/EI/CCF 等标签；标签以短标签展示、IF 类独立配色，CCF-A 会议名自动缩写。（a769cab1e、891558a10、30de679ca、0ae59158f、73ff2b7f5、efe0ef9bd、#464 by @Phil-Fan）
- 文件树多选批量操作：多选工具栏从树内浮动条移至固定侧栏头部，树高与滚动位置保持稳定；清除 / 移动 / 删除作用于整组，并补充键盘激活。（9b4457ecd、#462 by @qychen2001）
- 解析结果清理与重跑：设置 → 版面分析新增"清理"与"清理并重新解析"，可按版面 / 正文 / 全部范围整库删除派生结果并重新排队，执行前自动取消相关任务。（52821386a by @qychen2001）
改进
- 统一任务中心：论文入库、Connector 同步、文献库批量操作与模型下载统一经 JobCenter 调度，长任务可统一查看与取消，旧的并行后台任务机制移除。（953c9b3d8、4c72d649c、50d140041、30ef0eef4、b5e4fb422 by @qychen2001）
- 标题检索提速：Semantic Scholar 与 arXiv 标题检索并行竞速，S2 在 5 秒预算内优先返回；最坏耗时从约 40 秒降至约 20 秒。（78eb301ad by @Phil-Fan）
- 入库进度合并：并发下载多个附件时进度合并为一条上报，不再来回跳变。（db7729fa7 by @qychen2001）
- 依赖安全更新：清除 32 条 Dependabot 安全通告（undici、fast-uri、postcss、brace-expansion、dompurify 等）。（26eb899e6 by @qychen2001）
修复
- Windows 终端工具卡死：修复 Agent 终端类工具调用长期 Pending 或误报 Error 的五处 Host 缺陷：跨 await 持锁、output() 等待管道 EOF、kill 被子进程锁堵死、\\?\ 路径传入 Git Bash、initialize 共享预算过短（独立延长至 30 秒）；迟到的工具状态不再悬挂卡片。（#474 by @Zhou1317fe5）
- Windows 自定义 ACP Agent 启动：将 \\?\ 前缀路径还原为 CMD 可接受形式，并改用环境变量传递 cwd 与完整命令，修复路径含空格或特殊字符时启动报 Incoming transport closed。（#461、#458 by @Zhou1317fe5）
- 选区自动翻译：划词后按"自动翻译"设置生效，翻译期间选区工具栏保持可见。（0d9fafc25、ccc35ec8e、#463 by @Phil-Fan）
- 中文 PDF 字体：缺失嵌入字体时回退系统字体，中文 PDF 不再渲染异常。（6aa18431f、#454 by @Phil-Fan）
- 界面误选中文本：工具栏、侧栏、设置等界面区域不再被拖拽误选中。（93f4ab40c、#453 by @Phil-Fan）
- 魔棒输入法回车：中文输入法组词确认的回车不再触发标题搜索提交。（5894dbbca、#457 by @Phil-Fan）
- 符号链接 PDF: 通过符号链接放入的论文 PDF 在文件树中正确识别与打开。（49a8ebecd by @Phil-Fan）
- 面板拖拽误选：拖动分栏分隔条时不再触发文本选中。（a69332468 by @Phil-Fan）
- 标题搜索取消：关闭魔棒搜索卡片即取消后台标题检索，不再空跑到超时。（73ea9497c by @Phil-Fan）
已解决问题
- pi ACP 启动报错：pi 经 ACP 启动时报 initialize: Incoming transport closed，与 #458 症状一致，问题已随 Windows 自定义 ACP Agent 启动修复关闭。（#471、#461 by @Phil-Fan）

本次发布带来标题栏布局预设，可一键在 Agent、笔记、阅读三种工作区布局间切换；Plaza 来源管理移至文件树根节点菜单；Agent 安装过程支持随时取消。此外包含大量体验打磨：PDF 暗色模式配色柔化、紧凑输入框直接切换、视觉批注对话内嵌展示、面板分隔线与侧栏细节优化，以及跨页选区工具栏、数字前缀自然排序等多项修复。
新功能
- 布局预设：标题栏新增布局菜单，一键在 Agent、笔记、阅读三种工作区布局间切换，悬停即可打开。（ac7d2220、9ba0e6af、#447 by @Phil-Fan）
- Plaza 来源开关：移除 Plaza 概览页，arXiv Daily / RSS 等来源改为在文件树根节点的右键菜单中直接开关。（dd33791c by @Phil-Fan）
- 取消 Agent 安装：设置页与新手引导中的 Agent 安装/更新进度现在可以随时取消。（eaae98e2、#446 by @qychen2001）
改进
- PDF 暗色模式：降低反色与对比度，页面呈现柔和的深灰、文字不再刺眼。（a6085b6d、c42e4b19、#450 by @Phil-Fan）
- 紧凑输入框：输入框高度低于阈值时直接切换为单行紧凑形态，不再平滑过渡；上下文 chips 单行排列不再遮挡输入区，配置条过长标签以省略号截断。（16576b59、68e23cfe、886c2858、994ce71d、#449 by @Phil-Fan）
- 视觉批注对话：视觉批注绑定的 Agent 对话直接内嵌在右侧批注卡片中，默认截断、悬停展开；仅含对话的批注不再生成空卡片，改由装订线 pin 打开对话。（144a718c、68bf8a6a、4c99ba1c、#451 by @Phil-Fan）
- 面板分隔线：工作区分隔条默认仅显示 1px 细线，悬停与拖拽时呈现半透明高亮。（3147c48f、3bccb7e3 by @Phil-Fan）
- 侧栏细节：移除侧栏 header 分隔阴影；文件树图标槽位对齐；滚动条出现或消失时行布局不再跳动；论文行操作按钮与行右缘对齐。（ff3a8ca9、7eab618a、2442010a、47c8e679 by @Phil-Fan）
- Library 表格：移除行分隔线；年份、期刊与标签列不再支持点击复制，避免误触。（e0b5ea17、7753d330 by @Phil-Fan）
- 自定义 ACP Agent: 自定义 Agent 现在可以编辑；相对路径参数统一在 Vault 目录下解析；修复 Pi（pi-acp 适配器）不遵守会话 cwd 导致在系统目录下查找论文的问题。（719bfa1d、67e09083、bf22fefd、#441 by @Phil-Fan）
- 窗口最小宽度：主窗口新增最小宽度限制，避免过度压缩导致布局错乱。（c8fe07ca by @Phil-Fan）
修复
- 数字前缀自然排序：文件树中数字开头的前缀按数值排序（如 “2” 排在 “10” 之前）。（a753db3e、#445 by @Phil-Fan）
- 跨页选区工具栏：跨页选择文本时，工具栏锚定到光标结束页并限制在可视范围内，不再滚出视野。（0c94376c、#444 by @Phil-Fan）
- 窄面板换页控件：小宽度面板下 PDF 换页控件自适应布局。（9dccca02、#448 by @Phil-Fan）
- ACP 历史恢复：恢复历史会话时保留视觉批注与图片上下文，不再丢失裁切 chips。（8ad15643 by @Phil-Fan）
- Zotero 迁移提示：zotero.sqlite 缺失时的错误信息已本地化，并提示选择上级目录。（fbfa9283 by @qychen2001）
- Plaza 推荐卡片：arXiv 推荐卡片的标题与摘要过长时截断显示，避免溢出。（0baa64aa by @Phil-Fan）

本次发布聚焦阅读与 Agent 交互体验：Plaza 中的 arXiv Daily 与 RSS 订阅支持不下载即可预览、引用与 Agent 问答；Agent 对话区的模型、模式与引用上下文被收拢到更清晰的头部工具栏；同时补齐了 macOS Finder 与 Windows Explorer 的“用 Agentero 打开”右键集成，并修复了 PDF 滚动回跳、悬浮卡片堆叠、设置语言切换等细节问题。
新功能
- 远程 arXiv 预览与导入：Plaza 中的 arXiv Daily 推荐现在可直接在应用内以只读 PDF 预览打开，无需下载到 Vault；支持复制、Ask、加入对话、引用悬停预览，以及一键导入到论文库。 (#420, #429 by @Phil-Fan)
- RSS 订阅的 Agent 交互：RSS 订阅详情页中的条目正文支持复制、Ask 与加入对话，通过临时的 Ask 浮层与 Agent 交互。 (#421 by @Phil-Fan)
- Agent 对话区重新布局：模型、模式、Effort 与 Fast 开关被收入面板头部工具栏；引用、选区和 Skill 胶囊排列在提示框上方；发送按钮改为圆形上箭头并内联于输入区。 (#424 by @Phil-Fan)
- 系统右键“用 Agentero 打开”：macOS Finder 用户级 Quick Action 与 Windows Explorer 文件夹右键菜单均可将任意文件夹作为 Vault 打开；两者都直接传递目录路径，避免 URL 编码丢失特殊字符。 (#436 by @qychen2001)
- 删除论文时取消后台任务：删除论文会同时取消其排队或运行中的解析、下载、版面和元数据任务，防止进行中的下载重新创建已被移入废纸篓的文件夹。 (#432 by @qychen2001)
修复
- Agent ask-user 浮层不再阻塞全局快捷键：停靠式的 ask/permission 表单仍可通过 Esc / ⌘W 关闭，但不再标记为模态，因此 Cmd+B / Opt+Cmd+S 等侧边栏切换快捷键可继续使用。 (#425 by @Phil-Fan, @qychen2001)
- PDF 视觉批注并入评论侧栏：视觉标记现在统一显示在右侧评论卡片列；裁剪草稿保存备注后打开侧栏编辑；“加入侧栏对话”从悬浮卡片移至评论轨道。 (#396 by @Phil-Fan)
- PDF 悬浮卡片互斥与悬停驻留：引用/交叉引用预览与 Pin 卡片现在相互抑制，指针移动期间保持展开，移出后以更短的延迟收起，避免卡片堆叠。 (#430 by @Phil-Fan)
- Windows PDF 阅读位置不再跳回首页：当用户已经滚动到后续页面时，跳过阅读位置恢复逻辑，修复 WebView2 在分数 DPR 下 readiness 回调滞后导致的视图回跳。 (#427 by @Phil-Fan)
- 设置中的版面解析后端交互优化：API 密钥清空后立即持久化并回退到本地后端；只有一个可选后端时显示纯文本而非无效下拉框；禁用状态保持 Select 样式以稳定行宽。 (#433 by @Phil-Fan)
- 论文库空状态正确居中：空状态提示移出最小宽度 900px 的表格，改为在可见面板区域内填充并居中。 (#431 by @Phil-Fan)
- 标题搜索溢出与加载反馈：修复长标题撑破选择卡片的问题；提交标题类查询后立即显示 shimmer 加载，直到 Host 返回结果。 (#438 by @Phil-Fan)
- 设置窗口语言切换即时生效：在设置窗口中切换语言后立即调用 i18n.changeLanguage，无需刷新页面即可看到新语言。 (#437 by @Phil-Fan)
- Vault 打开时拒绝为已移动或删除的文件夹重建脚手架：ensure_vault 在路径缺失时直接报错，只有 create_vault 才会搭建新位置，避免恢复旧 Vault 时被静默重建为空目录。 (#439 by @qychen2001)
- 后台任务圆环完成动画：任务完成后圆环从短弧闭合到 100%，并播放简短的成功填充与对勾动画。 (#435 by @Phil-Fan)
- 引用导入等待真实后台任务结束：lookupSubmit 现在等待查找后台任务完成后才返回，导入图标会一直旋转到论文真正就绪。 (#434 by @Phil-Fan)
- Agent 输入框打字时无聚焦光环：textarea 聚焦时保持提示框边框不变，避免打字过程中出现高亮输入框闪烁。 (by @Phil-Fan)
- Agent 对话开始后隐藏顶部建议芯片：空状态工作流建议保留在对话记录中，但开始对话后不再在输入框上方重复显示相同提示。 (by @Phil-Fan)

本次发布聚焦导入流程、RSS 阅读与 Agent 集成：本地 PDF 导入不再被元数据解析阻塞，改为后台自动识别；Plaza RSS 的全文提取与 LaTeX 数学渲染更可靠；arXiv Daily 支持全量分类搜索与嵌入端点健康探测；设置中新增内置 ChatGPT Secure MCP Tunnel；并修复了 PDF 纯文本链接、围栏代码 HTML 属性丢失与 Grok Build 探测等问题。
新功能
- ChatGPT Secure MCP Tunnel: 设置 → 常规 → MCP 服务器可直接启动/停止内置隧道客户端，Tunnel ID 与运行时 API Key 由界面管理；密钥只经环境变量传递、应用退出时自动停止。（commit by @Phil-Fan）
- 后台识别本地 PDF 元数据：通过选择器或拖拽导入的 PDF 先秒级占位入库，随后后台任务自动探测并识别元数据；命中标识符会自动重命名论文目录并重写双链，与库中已有条目自动合并，期间用户的编辑始终优先。（commit by @qychen2001）
- arXiv Daily 分类自动补全：面板头部新增搜索弹出框，可从 arXiv 全量分类体系（约 150 个）中挑选分类，选中项以可删除的 chip 展示并持久化到本地。（commit by @Phil-Fan）
- Plaza 卡片显示/隐藏开关：悬停卡片即可通过眼睛图标隐藏或恢复数据源，隐藏源保持可见但置灰，侧栏右键菜单中的开关列表随之移除。（commit by @Phil-Fan）
改进
- 论文库刷新全部元数据字段：库中的刷新操作现在一次性更新全部元数据字段，而不再只更新发表信息。（commit by @Phil-Fan）
- 标题元数据链式解析：按标题补全元数据时按 S2 → Crossref → OpenAlex → S2 → arXiv 顺序链式尝试，提高命中率。（commit by @Phil-Fan）
- arXiv Daily 嵌入端点健康探测：面板展示结果前先探测嵌入端点，配置失效时不再显示过期缓存，而是进入不可达状态并提供重试/打开设置入口；Agent 设置中的嵌入区也新增了连接测试按钮。（commit by @Phil-Fan）
- 长会话虚拟化：Agent 聊天超过 80 行后自动切换为虚拟列表渲染，长对话不再拖慢界面，滚动到底与流式输出保持可用。（commit by @qychen2001）
- RSS 全文提取更可靠：以 DOM 可读性评分替代字符串匹配提取正文，并始终尝试抓取原始文章页；对返回 JS 挑战 403 的站点自动带 Cookie 重试。（commit by @Phil-Fan）
- RSS 数学渲染改进：LaTeX 块级环境按显示公式渲染，展开文档级 \newcommand 宏定义，清理提取过程残留的 HTML 产物并修复多公式占位符错乱，旧缓存正文会在新版本中自动重新解析。（commit by @Phil-Fan）
修复
- PDF 纯文本链接：未带链接注解的 http(s) URL 现在也能点击打开，arXiv 编号会映射到摘要页，支持同一区域内多个链接且不与原生注解重叠冲突。（#422 by @July-h5kf3）
- 围栏代码保留 HTML 属性：Markdown 往返编辑不再丢失围栏 HTML 代码中的 class、for 等属性，且只作用于 HTML 围栏，不影响 JSX/TSX 示例。（#423 by @Gelly52）
- Grok Build 改用原生 CLI: 探测与启动改为本机 grok agent stdio 命令而非 npx 封装，避免在未安装时被自动探测悄悄下载 Agent，并自动迁移旧的注册记录。（commit by @Phil-Fan）
- RSS 卡片高度溢出：修复 WebKit 下 -webkit-line-clamp 导致卡片摘要下方出现大片空白的问题。（commit by @Phil-Fan）

本次补丁版本聚焦阅读与编辑体验：长 Markdown 笔记的编辑性能显著提升，ACS 论文的图表、公式与文内引用悬停预览完整可用，PDF 顶部工具栏改为阅读时自动隐藏；同时新增论文笔记自动打开开关与 MinerU 语言 / 强制 OCR 选项，并修复重复入库、标签页标题恢复、Windows 下 arXiv HTML 视图与安装包 CLI 占位文件等问题。
新功能
- 论文笔记自动打开开关：设置 → 通用 新增「打开论文时自动打开笔记」选项（默认开启）。关闭后打开论文只显示 PDF/HTML 正文，笔记仍可通过 ⌘\ 或文件树「打开笔记」随时唤出。（#409，c33272a0 by @Phil-Fan）
- MinerU 语言与强制 OCR 选项：MinerU 服务商卡片新增「高级」折叠区，可指定识别语言（中英文 / 纯英文）并强制整页 OCR；两个选项同时作用于版面分析与 PAPER.md 正文解析，改善非中文论文的解析质量。（#402，4dbcc411 by @qychen2001）
改进
- 长笔记编辑性能：目录大纲只重扫描被编辑的块，块手柄菜单改为悬停时才挂载，全局拖拽状态不再触发所有块重渲染，块间距改为缓存读取——长文档的输入、悬停与拖拽开销显著下降。（b89c68bb / 31463c0a / 1bb9efb3 / 653bbe19 by @Phil-Fan）
- 新手引导文案：逐句重写引导向导的标题与选项文案为直白表述，并在每个步骤标题下新增一句说明，降低「版面解析」「自有 API」等术语的理解门槛。（91a540b7 by @Phil-Fan）
- PDF 顶部工具栏自动隐藏：阅读时两组悬浮工具栏自动淡出，滚动或指针靠近顶部时重新出现；打开面板、查找栏、框选或缩放输入框聚焦时保持固定。（#400，b84d52b9 by @Phil-Fan）
- Windows CLI 安装体验：设置 → 关于 中的 CLI 安装 / 卸载失败提示改为展示真实错误原因并完成本地化；安装成功后给出可复制的验证命令，下载 404 时附带完整资产地址，方便自查架构与版本是否匹配。（4149a80e by @JiaheChen2002）
- 标签栏与内容分界：工作区标签栏与下方内容之间新增分割线，避免同色系贴边。（#408，242d5c65 by @Phil-Fan）
修复
- 图表 / 公式悬停预览（ACS）: 修复 ACS 出版方 PDF 中 Figure / Table / Equation 悬停预览无法解析的问题：整页 /FitR 跳转目标冲突现按链接矩形与链接文本（Figure 1 / Table 1）消歧，并补充 /FitH 纵向锚点与无标题公式的顺序回退。（#407，61297c9e，1b22eb3a by @Phil-Fan）
- 文内引用悬停（ACS）: 修复 ACS 文献引用上标悬停不弹出预览的问题；14-18 形式的区间引用现在会展开列出 14…18 全部条目，预览卡片支持多条叠放，逗号分隔的相邻引用保持原样。（ac988f5e / f9f61f7c by @Phil-Fan）
- 分割线处回车：修复在分割线（hr）上按 Enter 无法在下方换行的问题，现在会在分割线下方插入新段落；同时收窄分割线的选择高亮，不再显示为高瘦空框。（#397，3a3c9e31 by @Phil-Fan）
- 标题间距：H1–H3 / H4–H6 的上间距改为固定档位，不再随标题字号放大，修复大标题与分割线叠加产生的过大空白。（#397，c5825c9f by @Phil-Fan）
- 目录侧栏：折叠态目录不再冒出悬停滚动条，行距与标记宽度收窄，观感更接近 Notion 的胶囊样式。（#395，1ef180f5 by @Phil-Fan）
- Agent 会话回放：重新打开 Claude Code 会话时，不再把「No response requested.」这类合成占位消息显示为 Agent 的回复；混合内容的轮次保留真实部分。（#411，c298eb21 by @Phil-Fan）
- 入库去重：本地 PDF 识别出的 DOI / arXiv / PMID / ISBN 命中目录已有条目时改为合并：原条目没有主 PDF 时补为正文，否则归入附件，不再重复创建条目；标识符入库也会在提交前交叉检查全部标识符列。（#406，e212940b by @Phil-Fan）
- Windows arXiv HTML 视图：修复 Windows 下切换 arXiv HTML 视图报 ERR_CONNECTION_REFUSED 的问题（WebView2 下自定义协议源应为 http 而非 https）。（#412，e0a4ea4a by @Phil-Fan）
- 标签页标题恢复：修复重启恢复工作区后，未激活的标签页只显示文件夹名、点进去才显示论文名的问题；恢复时直接使用持久化的标题。（#410，618a63b2 by @Phil-Fan）
- 期刊名称补全：期刊 / 会议名优先采用 Semantic Scholar 的 publicationVenue（Crossref 会截断 ACL/NAACL 等名称，arXiv 常缺失），修复期刊标签获取不全。（#399，6a0fedea by @Phil-Fan）
- 新手引导每次启动重弹：修复引导完成标记未被 Host 保存、每次启动应用都重新弹出新手引导与功能导览的问题。（#398，00557972 by @Phil-Fan）
- Windows 安装包 CLI 占位文件：修复全新安装的 Windows 上弹出「不支持的 16 位应用程序」系统对话框的问题——安装包曾附带伪装的 agentero-cli.exe 占位脚本。安装包不再捆绑任何 CLI 文件，可在 设置 → 关于 中下载安装同版本 CLI。（9dee13f0 by @JiaheChen2002）
已解决问题
- 新手用户引导（#369）: 新手引导已在 v0.9.0 上线；本版本完成面向新手的文案重写与引导状态持久化修复后，该 Issue 关闭。

v0.9.0 围绕「论文库信息补全、PDF 批注交互、Agent 与外部工具连接」进行迭代。新增本地 MCP 回环服务器、首次打开 Vault 的功能导览、Markdown 块级选区，以及统一的右侧批注评论列；同时优化了论文 publication 字段的展示与批量回填、Agent 面板刷新和设置页服务商配置。
新功能
- 本地 MCP 回环服务器：在 Settings 中开启后，Agentero 会通过 Streamable HTTP 向 ChatGPT/Codex 暴露当前 Vault，支持查询论文元数据、导入论文、读写 NOTES.md 与管理标签。(74067fae by @Phil-Fan, #391)
- 首次打开 Vault 的功能导览：基于 driver.js 的高亮引导，首次进入 Vault 时依次介绍侧边栏、魔棒、工作区、Agent 面板与标题栏，可在 Settings 中重新播放。(e96b7773 by @qychen2001)
- Markdown 块级选区：编辑器新增块拖拽手柄、块级选择与高亮，支持通过拖拽选中整段或整块内容。(f1a24e20 by @ffy6511, #390)
- 统一的 PDF 右侧批注评论列：所有批注评论统一在右侧评论列中就地编辑；悬停评论卡片会高亮对应页面区域，视觉批注也纳入评论列；PDF 左侧切换按钮统一为新的 PdfLeftToolbar。(105eed53, 5d8ac1b5, ce21be7e by @Phil-Fan, #379, #385)
- 论文库 Publication 列与批量回填：论文库新增独立的 publication 列并默认置于年份之后；支持从列标题一键批量回填缺失的 venue，导入时优先解析 arXiv journal_ref 并回退到 Semantic Scholar，批量回填使用 10 并发后台执行。(1ba98983, 377fdc76, e3a86cd7, f889f8c6 by @Phil-Fan, #389)
改进
- Agent 注册表事件走生命周期总线：agent:registry-changed 改为通过 lifecycle bus 分发，避免直接监听 Tauri wire 事件的泄漏型 Promise 模式，并在 Agent 面板中防抖刷新列表，确保 Settings 中安装/探测 Agent 后切换器立即更新。(812fbd03, 6f7fadf0 by @qychen2001)
- 设置页布局服务商配置：Layout 设置面板改为以 credential 卡片形式列出所有远程服务商，未配置 API Key 的服务商不会出现在后端选择列表中；默认值直接预填入输入框而非仅作占位提示。(0b6656ca by @qychen2001, #394)
- Agent 对话引用展示简化：移除消息内联的引用角标，仅保留底部的 sources 列表。(da3befeb by @Phil-Fan, #378)
- 论文库刷新性能与进度：批量刷新 publication 改为并发执行并实时更新 UI，降低并发数、显示每篇论文的统计信息并从 0 开始展示进度。(ee25385a, 90c16a67, 607c2162 by @Phil-Fan)
- MCP 服务器元信息：MCP 初始化时返回应用图标数据 URI，并为工具附加 outputSchema，便于 ChatGPT 等客户端结构化解析返回结果。(a92067a3 by @Phil-Fan)
- 升级 dsh ACP 依赖：将 dsh npm 包与 launcher 更新到 0.1.1-rc.2，保持 Agent 协议兼容。(2202dc7e by @Phil-Fan, #374)
修复
- 文件树文件夹优先排序：默认文件夹排序模式下，组织文件夹现在排在论文文件夹之前，符合常见文献库习惯。(ef1ce18b by @Phil-Fan, #387)
- Markdown H1 顶部间距：收紧编辑器中 H1 的顶部边距，减少笔记开头 # Title 前的大段空白。(87df769d by @Phil-Fan, #377)
- ModelScope 广场导览阻塞滚动：屏蔽 ModelScope 论文广场首次加载时弹出的 antd5 tour，避免其注入 overflow-y: hidden 导致面板无法滚动。(ae46fe72 by @Phil-Fan, #375)
- arXiv 学科标签隐藏：arXiv 导入的学科分类现在以 @arxiv: 前缀存储并按隐藏标签处理，不再混入普通标签、搜索与筛选，CLI 默认也不输出，除非使用 --all。(1074ee71 by @Phil-Fan, #380)
- PDF 高亮坐标归一化：将高亮矩形坐标统一归一化为页相对坐标，避免不同缩放或渲染模式下批注位置偏移。(8e7f3783 by @Phil-Fan)
- 评论卡片禁用文本选择：防止鼠标在右侧评论列批注卡片上触发页面文本选择。(2905fc70 by @Phil-Fan)
- 旧版论文库列顺序迁移：自动将旧版列顺序迁移为「年份后紧跟 publication」，避免升级后列顺序异常。(8cef7c99 by @Phil-Fan)

本次发布聚焦论文入库与侧栏工作流的可用性：可配置新论文 NOTES.md 初始化模板、支持在文件树中隐藏广场源并直接编辑论文元数据、论文库行新增删除/定位/加入对话操作，并修复了远端 MinerU 令牌探测的误判。
新功能
- 笔记初始化模式：新增 paperNoteMode 设置（标准 / 仅标题 / 空白 / 自定义），控制各入库路径（魔棒、本地 PDF、Zotero 迁移、Connector、远端、coolpapers）新建论文的 NOTES.md 模板；自定义模式渲染 .agentero/templates/NOTES.md 并注入元数据变量，所有模式均保留 aliases 双链。设置页提供一键生成起始模板命令，且永不覆写已有笔记。（#386 by @qychen2001）
- 隐藏广场源与编辑元数据：新增 plazaHiddenSources 设置，可右键单个广场源将其在侧栏与广场首页隐藏，右键广场根节点批量显隐；同时把论文库元数据编辑器接入文件树论文行右键菜单，与论文库行操作保持一致。（#388 by @qychen2001）
- 论文库行右键菜单：论文库表格行右键菜单复用文件树操作，支持直接将论文移入回收站、在文件管理器中定位，以及作为上下文附加到 Agent 对话。（commit by @qychen2001）
修复
- MinerU 令牌探测：mineru.net 现在以 -10002（而非 -500）应答空文件列表探测，并通过 msgCode 在 HTTP 401 下报告鉴权失败；旧校验白名单会误报有效令牌为失败。现同时读取 code 与 msgCode，只要是非鉴权业务响应即视为令牌有效。（commit by @qychen2001）

v0.8.1 是一次聚焦稳定性与易用性的小版本补丁。主要修复了 Windows 系统代理回退、MinerU 云端版面分析结果解析，以及清理了 PDF 工具栏中已失效的批注入口；同时为设置 About 页和 Agent 历史标题带来了两处细节改进。
新功能
- 设置 About 页打开日志文件夹：在设置 → 关于中新增“打开日志文件夹”操作，用户反馈问题时可直接在系统文件管理器中定位日志目录，便于导出与排查。（78b0084e by @qychen2001）
- Agent 会话标题实时同步：转发 ACP 的 session_info_update 通知为 agent:session-info 事件，Agent 主动推送的会话标题会按运行时 id 或 providerSessionId 实时更新历史记录中的对应行，且不会覆盖视觉化追踪的标题。（bf6ac1f5 by @qychen2001）
修复
- MinerU 云端 layout.json 结果解析：兼容 MinerU Cloud v4 结果 ZIP 中 layout.json（无任务 ID 前缀）的命名方式，修复此前因找不到 *middle.json 导致的版面分析失败，并为两种命名都添加了回归测试。（954bf4c5 by @qychen2001）
- PDF 工具栏移除失效批注按钮：v0.8.0 移除右侧栏 Annotations 标签页后，PDF 工具栏的“批注”按钮仍指向已不存在的面板，点击后会跳回 Agent 面板；现移除该按钮及整个 onOpenAnnotations 调用链，关闭 #381。（4250b27b by @Phil-Fan）
- Windows 系统代理回退：当应用代理关闭时，Host 网络请求现在会检测 Windows 注册表中的系统代理（支持 http= / https= / socks= 形式）并作为回退使用，修复 Clash/V2RayN 等“系统代理”模式下 Plaza、Feeds 等应用内页面无法加载的问题；通用设置页在代理关闭时显示“已检测到系统代理”，关闭 #376。（b439b31c by @JiaheChen2002 and @qychen2001）

v0.8.0 聚焦 Agent 工作流、PDF 阅读器界面、CLI 效率与同步体验的打磨。新增 ACP Terminal 能力、PDF 悬浮图表/参考文献面板、同步范围控制，并优化了文件树默认展开、Agent 链接跳转、Onboarding 等细节交互。
新功能
- ACP Terminal 终端能力：Agent 现在可以通过 ACP terminal 能力执行本地终端命令；针对 Kimi 等未原生暴露 terminal 的 Agent 补充了路由与权限适配说明。（#365 by @Phil-Fan）
- PDF 悬浮图表面板：PDF 阅读器新增独立的浮动 Figures 面板，可在页面外查看论文图表，不再占用右侧边栏空间。（461918cd by @Phil-Fan）
- PDF 悬浮参考文献面板：参考文献面板同样改为浮动形式，方便在阅读时随时查看引用列表。（3f1888c1 by @Phil-Fan）
- 同步范围控制：新增同步作用域设置，可跳过论文附件等大体积资源、仅同步 metadata；设置面板同步展示连接状态、提供商指引与连接入口。（#360 by @qychen2001, @Phil-Fan）
- Agent 身份在全局共享：当前选中的 Agent 身份现在通过 chrome store 在应用内部共享，标题栏右侧的切换按钮也替换为当前 Agent 的 logo。（67eb212d by @Phil-Fan）
- CLI 阅读标注：CLI 支持从文本引用写入高亮、批注与翻译标注，并可通过 PDFium 文本引擎将引用定位到具体页面区域。（feb22dc9 by @Phil-Fan）
- 缺失 PDF 标记与重下载：论文库会标记没有本地 PDF 的论文，并提供重新下载入口。（72c21749 by @qychen2001）
改进
- 文件树默认展开：打开 Vault 时仅展开 papers/ 本身，其下的一级组织子文件夹默认保持折叠，减少初始视觉噪音。（#357 by @byy-yby）
- Agent 链接直接跳转：移除 Agent 消息中链接点击的安全弹窗，正文与思维链中的链接直接打开系统浏览器，避免 Tauri 重复打开窗口。（#356 by @byy-yby）
- CLI 输出瘦身：paper list --json 默认仅输出 id/path/title，体积降至原来的约 3%；JSON 默认紧凑单行输出，并新增 --pretty/--fields/--full 选项，显著降低 Agent token 消耗。（#367 by @Phil-Fan）
- PDF 批注与侧边栏重构：批注评论改为固定在页面外侧的持久 rail 中，右侧边栏不再包含 References/Figures/Annotations 标签页，让阅读区域更专注。（e2f848c6 by @Phil-Fan）
- Agent 历史标题自动补全：对于不返回会话标题的 ACP Agent，自动从首条用户消息推导标题，让历史抽屉更可读。（#359 by @Phil-Fan）
- Onboarding 与 Agent UI 细节：新手引导页显示 Agent 安装进度并去除滚动条；Agent Composer 的推理强度下拉可正常点击；聊天复制按钮新增复制成功反馈态。（449bbf2a by @Phil-Fan）
- 论文信息面板精简：统一资源链接宽度并简化操作按钮，使侧边栏论文信息更整洁。（c706da95 by @Phil-Fan）
- 标题栏布局菜单移除：移除标题栏中的布局菜单，简化顶部操作栏。（32790949 by @Phil-Fan）
- ACL Anthology PDF 导入：魔棒导入 ACL Anthology 论文时自动从 landing page 推导 PDF URL，修复该来源无法下载 PDF 的问题。（#363 by @Phil-Fan）
- 移除引用图谱：移除使用率低且依赖较重的引用图谱功能及相关库，简化安装包体积。（433a9090 by @Phil-Fan）
修复
- 阿里云 OSS 同步失败：对不支持 If-Match/If-None-Match 条件写的后端（如阿里云 OSS）自动降级为普通 PUT，并在设置面板提示非原子写入。（#362 by @qychen2001）
- PDF 右侧边栏控件显示：修复 PDF 页面右侧控件在不同宽度下被截断或缩放的问题，保持固定尺寸并始终可见。（ee71c738 by @Phil-Fan）
- Source 外部链接跳转：外部 source 链接统一使用系统浏览器打开，避免打开空的 in-app webview；纯 action source 渲染为按钮而非链接。（f5e1af7b by @Phil-Fan）
- 工作区空 dockview 分组：恢复布局时压缩空的 dockview 分组并同步成员关系，避免残留空面板。（8c40b385 by @Phil-Fan）
- Terminal 输出读取完整性：在读取捕获输出前等待 terminal 输出 reader 完成，避免 ACP terminal 命令输出不完整。（2a45cdd5 by @qychen2001）
- Sources 块解析：识别纯文本 Sources 块并去除 [blocked] 标签，提升 Agent source 引用解析的稳定性。（616527db by @Phil-Fan）
已解决问题
- 右侧栏标签页放入 PDF 页面内：将 References/Figures 面板从右侧边栏移入 PDF 阅读器区域，以浮动形式呈现。（#373 by @Phil-Fan）
- 调整默认 Agent 位置与顺序：当前 Agent 身份在标题栏和面板间保持一致，切换入口改为当前 Agent logo，使默认 Agent 展示更直观。（#372 by @Phil-Fan）

概要
v0.5.0 以 PDF 版面理解与阅读体验、知识库 Doctor、翻译与 Agent 一键安装 为主线：
- 解析论文中插图、表格、算法、公式
- 并支持版面全文翻译，补充 BYOK 翻译服务
- CLI 性能 与 doctor 页面
- Agent 一键安装
- 提升 PDF 渲染性能
新功能
- PDF 版面分析：接入 PP-DocLayoutV3，打开论文或入库后可自动/后台解析，结果缓存为 source/layout.json，并生成与侧栏同构的 layout-index.json。（dc154164、fb6e318c、f05d5bb0）
- 插图 / 公式侧栏：阅读侧栏按图片、表格、算法与带编号公式分组展示，支持版面控件与分析进度，悬停可发起视觉提问。（61ffcf56、21799ee6）
- 版面全文翻译：按阅读顺序批量翻译正文/摘要/标题/图注等区域，译块完成即叠纸色遮罩，并适配暗色模式。（96260eab、2a95f440）
- Vault Doctor: 设置页与 CLI 提供只读诊断（目录结构、Catalog、双链、论文 aliases），修复前需确认；可生成英文/中文别名、探测坏链并 git 风格 diff 批量写入，也可把提示词交给 Agent；支持别名检查忽略/恢复。（#210、#217、22049895）
- 商业翻译 BYOK 与 DeepLX: 设置中可配置商业翻译提供商并探测可用性；默认免费链路纳入 DeepLX，状态以彩色圆点展示。（42da9797、eb256418、0b9e64f9）
- Agent 静默安装 / 升级：设置里分别展示 Agent 与 ACP 状态，支持无终端确认的安装、安装 ACP 与已装 CLI 升级；常用 Agent 列表位置与文案一并调整。（536ebaf0、57f931c9、37a0dd22）
- 划词钉到对话：PDF 划词提问会写入 agent-trace，在页边形成可回看的对话钉与选区卡片。（7cf52f7a）
- equation-annotation Skill: 内置公式/变量批注 Skill，可生成中英对照的 Annotation.md 术语表。（3a54eadb）
- CLI layout 与区域 mark: agentero layout list/get 读取版面索引；mark add --region 等支持区域锚点批注，默认高亮色与桌面一致为黄色。（41e4d340、47111be0）
- 诊断遥测（可退出）: 可选诊断上报（崩溃、错误日志、设备与已装 ACP 等），本地队列批量上传；设置 → 通用 → 隐私可关闭或手动发送。（96605306）
- 标题栏更新标签：有可用更新时显示「新版本」标签，点击下载安装并重启。（11866065）
- 后台任务进度环：后台任务以进度环展示，悬停或点击展开详情。（b35a7f58）
- PDF 独立配色：阅读器可独立切换配色，不必跟随系统主题。（51766376）
- 编辑器属性入口：Frontmatter / Properties 移入工具栏，阅读整理路径更短。（17091517）
- 侧栏 arXiv 链接：论文信息区补充 arXiv 相关服务入口。（9f3375fb）
改进
- PDF 渲染性能：优先 Worker 引擎（失败回退主线程），限制 base-coat / DPR，放大 tile、预渲染外围环、合并缩放步进，减轻滚动闪白与卡顿。（60d06459、9985326c、9af0991e）
- PDF 阅读控件：适应缩放移至底部分页旁；选区卡片贴钉定位；视觉批注缩略图进侧栏；背景任务默认收成环。（5a1a22a5、0cc51ae6、178e9106）
- Catalog 单一数据源：不再写入 metadata.json / reading-meta.json，论文元数据以 .agentero/catalog.sqlite 为准，页数等直接读 PDF。（1dd7839a、5528b349）
- 内置 Skill 按 version 升级：以 frontmatter version 比较替代 hash；版本更低才升级，用户更高/自定义版本保留。（#224）
- 去掉 Zen 模式：Agent 专注布局入口移除，面板与快捷方式统一到常规壳层。（ae47149f）
- Agent 排队计数：作曲区显示已排队提示数量。（9e7b7732）
- Zotero 集合目录默认开启：迁移导入默认按集合建文件夹。（0635b867）
修复
- Agent 历史会话恢复：打开历史不再空白；同会话续聊不再拆成多条；续聊偶发只显示提问的问题已处理。（#221）
- AskUserQuestion 转发：Agent 向用户提问后的回答会正确回传会话。（2905443a）
- ACP 斜杠命令名：去掉命令名中多余的 $，避免 slash 转发错误。（990dd3d5）
- Zotero Connector 附件：正确声明 filesEditable 并解析 PDF，修复仅写入元数据、缺附件（如 IEEE 落地页）的情况。（d22f47fe）
- 索引文件夹下嵌套论文：组织目录带 index NOTES.md 时不再吞掉子论文单元。（b7b62ac8）
- 非论文标签保留信息栏：切到非 paper 标签时论文信息不被清空。（717a5bc0）
- CLI 入库后库刷新：文件监听/导入后元数据与论文库及时更新。（2e594f85）
- 版面分析细节：同栏公式合并、双栏顺序、图文误标、可无 ONNX 从 layout.json 重分析等多项稳定性修复。（c1800c4a、6ace73e7、8c5cefa7）
已解决问题
下列在区间内关闭、且已由上方条目覆盖的 issue 不再重复展开：#193、#198、#209、#215、#182、#201、#200、#203、#225、#218、#204、#219、#170（区域部分）、#148（体验相关）。